3′RACE法扩增谷氨酰胺合成酶基因及其生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张志灯
作者: 张志灯;罗土炎;饶秋华;曹治云;郑腾
作者机构:
关键词: 谷氨酰胺合成酶基因;3′RACE;生物信息学
期刊名称: 福建农业学报
ISSN: 1008-0384
年卷期: 2012 年 27 卷 09 期
页码: 11-15
摘要: 以抽提得到的黑曲霉mRNA为模板,根据GenBank上检索的谷氨酰胺合成酶基因mRNA序列,设计特异性引物,进行3′RACE PCR扩增,并在NCBI网站进行生物信息学分析。结果扩增得到长约1kb的DNA片段,测序结果表明,所获得的DNA序列与gene bank上检索到黑曲霉产谷氨酰胺合成酶基因的同源性大于97%,与其他曲霉产谷氨酰胺合成酶的基因同源性大于50%。经开放阅读框软件分析发现其具有2个外显子,其中1个外显子的氨基酸序列与黑曲霉产GS同源性为100%。
分类号: Q786
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