倒刺狗尾草叶绿体基因组特征及系统发育分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刁玉霖
作者: 刁玉霖;李竑阳;张海金;张文飞;王凯玺;朱康宁;张蒙;孙鑫;李前;陈国秋
作者机构:
关键词: 倒刺狗尾草;叶绿体基因组;系统发育
期刊名称: 种子
ISSN: 1001-4705
年卷期: 2024 年 008 期
页码: 45-51,59
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了对倒刺狗尾草叶绿体基因组的基本特征和系统发育进行分析,本研究对倒刺狗尾草的叶绿体基因组进行了测序,并对测序结果进行组装、注释和特征分析,并以拟南芥为外类群,利用15种已知叶绿体基因组的禾本科植物构建系统发育树。结果表明,倒刺狗尾草叶绿体基因组总长度为138 946 bp,总GC含量为38.5%,共注释得到131个基因,包括83个CDS基因、40个tRNA基因和8个rRNA基因。密码子偏向使用A/T结尾的密码子。倒刺狗尾草检测到60个简单重复序列(SSR),A-T重复较多。通过系统发育分析得知,倒刺狗尾草与蒺藜草亲缘关系最为密切。
分类号: S544.3
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