豇豆抗锈病全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴健

作者： 吴健;汪宝根;陈小央;吴晓花;李潇;韩磊;汪颖;王尖;鲁忠富;杨易;张艳;李国景;吴新义

作者机构：

关键词： 豇豆;锈病;关联分析;重测序

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2024 年 25 卷 011 期

页码： 1907-1922

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 豇豆是世界范围内重要的豆类作物，在我国既是重要的杂粮作物，也是传统的豆类蔬菜作物。锈病是豇豆生产上三大主要病害之一，选育抗锈病品种是防治锈病最经济有效的策略，筛选抗锈病种质、解析其遗传基础是抗锈病育种的关键和前提。本研究对215份豇豆地方品种进行抗锈病精准鉴定，筛选出40份抗锈病种质。利用重测序技术鉴定了215份种质的基因型，获得3880169个高质量SNPs和469398个高质量InDels。群体结构分析将之分为4个亚群，亚群分类与荚长、荚型高度相关。采用全基因组关联分析，鉴定出10个与锈病抗性显著相关的基因组区段，分布在7条染色体上。单倍型分析显示各峰值SNP的不同等位变异与锈病抗性高度相关，且随着有利等位变异的聚合，群体内抗病材料的比例显著升高。本研究鉴定出10个可能的抗锈病候选基因，包括含BTB/POZ结构域蛋白基因、LRR受体类丝氨酸/苏氨酸激酶基因、乙烯反应转录因子、交替氧化酶基因等。本研究为豇豆抗锈病分子育种提供了理论指导和基因资源。

分类号： S643.4

  • 相关文献

[1]长豇豆锈病抗生遗传研究. 张衍荣,方木王. 1997

[2]利用SLAF-seq结合BSA方法发掘大豆种皮色相关基因. 郁晓敏,金杭霞,杨清华,傅旭军,郭丹丹,吕晓男,袁凤杰. 2021

[3]SSR标记与花生青枯病、锈病抗性的相关性研究. 洪彦彬,温世杰,钟旎,李杏瑜,朱方何,梁炫强. 2011

[4]长江下游地区地方鸭种全基因组序列测定及遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫. 2016

[5]利用混池重测序鉴定萨福克绵羊超数排卵关键调控基因. 滑留帅,辛晓玲,王璟,罗生金,曾滔,巴提玛,施巧婷,徐照学,王二耀. 2019

[6]利用重测序染色体片段代换系群体定位水稻籽粒长宽比QTL. 卫纯洁,陶亚军,范方军,李文奇,王芳权,许扬,陈智慧,仲维功,杨杰,王军. 2020

[7]不同光周期条件下谷子株高的全基因组关联分析. 贾小平,张博,全建章,李剑峰,王永芳,袁玺垒. 2019

[8]基于重测序番茄InDel标记的开发. 张国儒,唐亚萍,杨涛,帕提古丽,王柏柯,李宁,王娟,李晓琴,余庆辉,杨生保. 2019

[9]基于高通量测序的棉花InDel标记开发及其应用. 陆海燕,陈璐,王显生,赵涵,沈奇. 2019

[10]基于高通量测序的棉花InDel标记开发及其应用. 陆海燕,陈璐,王显生,赵涵,沈奇. 2019

[11]利用重测序技术开发高粱多态性SSR分子标记. 王平,王春语,张丽霞,丛玲,朱振兴,陆晓春. 2019

[12]全基因组选择技术在反刍动物遗传育种中的研究进展及其应用. 张顺进,寇浩玮,丁晓婷,刘贤,蔡雯雯,张子敬,施巧婷,茹宝瑞,雷初朝,黄永震. 2021

[13]基于重测序的芥蓝(Brassica alboglabra)全基因组InDel标记开发. 洪晓如,吴智明,陈汉才,黎庭耀,沈卓,张艳. 2021

[14]基于高密度SNP遗传图谱的粳稻芽期耐低温QTL鉴定. 姜树坤,王立志,杨贤莉,李波,母伟杰,董世晨,车韦才,李忠杰,迟力勇,李明贤,张喜娟,姜辉,李锐,赵茜,李文华. 2020

[15]基于高通量测序的大麦InDel标记开发及应用. 徐婷婷,汪巧玲,邹淑琼,狄佳春,杨欣,朱银,赵涵,颜伟. 2020

[16]长三角地区兼用型鸭全基因组遗传多样性分析. 章双杰,王靖,杨建生,李慧芳,宋卫涛,许金根,华国浩,叶彩芳,林雨鑫,刘怡. 2017

[17]耐盐转基因大豆事件AtARA6-A001外源插入片段侧翼序列及其应用. 孙星邈,侯云龙,王英哲,关诗宇,邱红梅,张玲. 2024

[18]大粒香基因组重测序分析. 龙武华,刘毅,姜雪,李祖军,吴娴,朱速松. 2024

[19]烤烟品种中川208特异性指纹图谱的构建及分析. 贾振国,王亚男,罗成刚,张玉,耿锐梅,陈志强,杨爱国,刘国祥,任民. 2023

[20]桑叶葡萄叶绿体基因组及其特征分析. 杨亚蒙,焦健,樊秀彩,张颖,姜建福,李民,刘崇怀. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序