基于转录组测序筛选与柚裂果相关的基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 卢艳清

作者： 卢艳清;林燕金;王贤达;卢新坤

作者机构：

关键词： 柚(CitrusgrandisL.Osbeck);裂果;果皮;转录组;抗裂基因

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2023 年 56 卷 020 期

页码： 4087-4101

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]柑橘类果实生长季节内出现的裂果现象是一类生理失调病害,然而目前尚未完全揭示柑橘类果实裂果的分子机理.本研究通过对文旦柚抗裂和易裂品种果皮转录组的比较分析,筛选果实抗裂相关基因.[方法]以抗裂品种('度新1号文旦柚')的正常果(此品种无裂果),以及易裂品种('度尾文旦柚')的正常果和裂果为材料,果实均取自两个时期(时期A:2021 年8 月3 日;时期B:2021 年8 月20 日,裂果敏感期).取果实果顶部位的果皮(以果顶为中心,30 mm半径范围内的果皮)用于转录组测序.[结果]将易裂品种裂果果皮与两品种正常果果皮转录组进行比较分析,在时期A 共筛选到1660个差异基因,易裂品种裂果果皮与两品种正常果果皮间相同的差异基因104 个;在时期B共筛选到1972 个差异基因,易裂品种裂果果皮与两品种正常果果皮间相同的差异基因82 个.对易裂品种裂果果皮与两品种正常果果皮间所有差异基因的GO 富集分析结果显示:在生物学过程分类中,两个时期均富集到差异基因的主要亚类包括代谢过程、细胞过程、单生物过程、生物调控、刺激响应和信号.对易裂品种裂果果皮与两品种正常果果皮间所有差异基因的代谢通路分析结果显示:两个时期均富集到差异基因的主要代谢途径包括碳代谢、植物MAPK信号途径、植物激素信号转导和内质网蛋白过程,这些代谢途径富集的差异基因也最多.发现了一些与果实抗裂能力相关的重要基因:两品种正常果果皮扩张蛋白-A1 基因表达量均显著高于易裂品种裂果果皮,两个时期结果一致;在时期A,两品种正常果果皮类钙调磷酸酶蛋白B 亚基基因表达量显著高于易裂品种裂果果皮,但在时期B 无显著差异;易裂品种裂果果皮热激转录因子、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、生长素响应蛋白和脱水响应元件结合蛋白基因表达量显著高于两品种正常果果皮,两个时期结果一致.[结论]与果皮弹性、水分运动、高温和水分亏缺逆境响应相关的基因是调控文旦柚果实抗裂能力的关键基因.

分类号： S666.3

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