冰菜盐胁迫下的转录组分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 练冬梅

作者： 练冬梅;赖正锋;姚运法;林碧珍;洪建基

作者机构：

关键词： 冰菜;盐胁迫;叶片;转录组;差异表达基因

期刊名称： 热带亚热带植物学报

ISSN： 1005-3395

年卷期： 2019 年 27 卷 003 期

页码： 279-284

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解冰菜(Mesembryanthemum crystallinum)叶片抗盐相关基因组学,利用Illumina Hi-seq TM2500高通量测序技术研究冰菜叶片在400 mmol L-1 NaCl胁迫下转录组基因的差异表达.结果表明,从400 mmol L-1 NaCl胁迫和对照的冰菜叶片中共获得13.01 Gb Clean data,Q30碱基均大于90.08%.共获得123个差异表达基因(DEGs),包括73个上调基因,50个下调基因,其中功能注释的基因有96个.根据Unigene库序列进行GO、COG和KEGG注释,筛选出8个与抗盐性相关差异表达基因,植物激素代谢相关基因,脱落酸8?-羟基化酶、吲哚-3-乙酰酸酰胺合成酶和茉莉酮酸酯ZIM结构域蛋白基因均下调表达,生长素响应蛋白、细胞分裂素合酶基因则上调表达,糖代谢相关基因棉子糖合成酶基因上调表达,质膜H+-ATPase基因上调表达,脱水蛋白基因下调表达.这为冰菜耐盐基因组学和分子生物学的研究奠定基础.

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