线辣椒SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李全辉

作者： 李全辉;李江;邵登魁;王亚艺;侯全刚;钟启文

作者机构：

关键词： 线辣椒;SSR;体系优化;引物筛选

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2017 年 07 期

页码： 1047-1053

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以循化线辣椒果实黄色突变体H0809和高代自交系0599-1为试材,采用L_9(3~4)正交试验设计,研究线辣椒SSR-PCR反应体系的主要成分对扩增结果的影响,并对420对SSR分子标记进行筛选。结果表明,最优的反应体系为:总体积20μL,基因组DNA 20 ng,dNTP 100μmol·L~(-1),引物0.6μmol·L~(-1),Mg~(2+)2.5 mmol·L~(-1),Taq DNA聚合酶1.5μmol;通过筛选,获得72对具有多态性的SSR标记,多态性率为17.1%,平均每个标记扩增出2.67个等位基因。本试验建立的SSR-PCR反应体系和筛选的多态性标记可用于线辣椒种质资源分析、分子标记辅助育种、分子遗传图谱构建及基因克隆等研究。

分类号： S641.3

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