茶树新梢cDNA文库的构建和ESTs测序成功率初步分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈亮

作者： 陈亮;赵丽萍;高其康

作者机构：

关键词： 茶学;茶树[Camelliasinensis(L.)O.Kuntze],新梢,mRNA,cDNA文库,EST,测序

期刊名称： 茶叶科学

ISSN： 1000-369X

年卷期： 2004 年 24 卷 01 期

页码： 18-22

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 报道了国内第一个茶树cDNA文库的构建及其EST测序成功率分析。以Trizol一步法从龙井43春茶新梢中提取总RNA,分离纯化富含Poly (A)的mRNA,LD-PCR反转录合成双链cDNA,以λTripEX2为载体,构建了龙井43新梢cDNA文库。以XL1-Blue为受体菌测定原始文库的滴度为6.8×105 pfu/ml,总克隆数为3.5×105个,重组率为98.05%,扩增后文库总滴度为7.2×109 pfu/ml。对随机挑取的噬菌斑进行PCR鉴定,表明插入片段大多分布在0.5-2.0 kb之间,绝大部分在1.0-1.5 kb左右。文库质量鉴定结果表明,构建的茶树新梢cDNA文库具有较好的库容量、较高的重组率以及较大的插入片段。对4320个克隆的序列测定表明,获得有用序列2963个,测序成功率为68.5%,剔除短序列后,首批共获得1687个茶树ESTs。

分类号： S571.1

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