青海高原牦牛PRDM16基因克隆、生物信息学及组织差异表达分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 赵生军

作者: 赵生军;张勇;郭宪

作者机构:

关键词: 青海高原牦牛;PRDM16基因;背最长肌;基因表达

期刊名称: 中国畜牧兽医

ISSN: 1671-7236

年卷期: 2016 年 43 卷 02 期

页码: 363-370

收录情况: 北大核心

摘要: 本研究对青海高原牦牛PRDM16(PR domain containing 16)基因部分编码区进行克隆及生物信息学分析,同时对PRDM16基因在雌、雄牦牛背最长肌肌肉组织中的表达差异进行了分析。选取雌、雄青海高原牦牛各5头,屠宰后采集背最长肌肌肉组织,克隆牦牛PRDM16基因部分CDS区序列,分析其生物信息学特征;应用实时荧光定量PCR技术检测PRDM16基因在雌、雄牦牛肌肉组织中表达水平。结果显示:克隆所得片段序列长323bp,与黄牛同源性为100%,编码99个氨基酸,具有MDS1-EVI1(complex locus protein MDS1)家族蛋白功能,具有CATH蛋白功能活性,包含卷曲螺旋等典型结构域,与人甲基转移酶蛋白结构域PR蛋白1有20%的相似性;PRDM16基因在雌性牦牛肌肉组织中表达水平极显著高于雄性牦牛(P<0.01)。本试验结果为进步一研究青海高原牦牛PRDM16基因奠定了基础,为牦牛肉品质分析提供参考。

分类号: S823.85

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