一株洞庭湖候鸟新城疫病毒的分离鉴定及基因组特征分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李小阳

作者: 李小阳;吉艳红;刘彬;朱启运;李郁

作者机构:

关键词: 新城疫病毒;序列分析;弱毒株;基因Ⅰ型

期刊名称: 中国兽医科学

ISSN: 1673-4696

年卷期: 2015 年 45 卷 12 期

页码: 1211-1217

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为监测湖南省洞庭湖候鸟携带新城疫病毒的现状,本研究于2014年春季在湖南洞庭湖畔采集了150份候鸟粪便样品。经SPF鸡胚分离纯化和RT-PCR鉴定,获得1株新城疫病毒,命名为Swan/Hunan/123/2014(HuN,GenBank登录号:KT894018)。利用RT-PCR方法扩增了HuN株全基因组,并进行基因组序列测定。序列分析表明,HuN株基因组长度为15 186bp,编码的F蛋白裂解位点的氨基酸序列为112 GK-Q-G-R-L117,符合新城疫经典弱毒株的分子特征。F基因相似性分析显示,其核苷酸序列与Queensland V4疫苗株、La Sota疫苗株和ZJ1毒株的同源率分别为99.8%、90.4%、81.3%。对HuN株的F基因、HN基因和全基因组遗传进化分析结果均显示,此毒株与Queensland V4株聚为一类,属于副黏病毒血清1型中的ClassⅡ类基因Ⅰ型新城疫病毒。

分类号: S852.65

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