牦牛A-FABP基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 秦文

作者： 秦文;阎萍;裴杰;吴晓云;李天科

作者机构：

关键词： 牦牛;A-FABP基因;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2013 年 11 期

页码： 86-91

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以牦牛的脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因为研究对象,根据GenBank收录的牛的A-FABP基因的mRNA序列设计一对特异性引物,以牦牛背最长肌为材料,采用RT-PCR方法克隆牦牛A-FABP基因的CDS区,并对其进行生物信息学分析。结果表明,牦牛A-FABP基因的CDS区全长399 bp,编码132个氨基酸;其编码的蛋白属于亲水性蛋白。二级结构主要由α-螺旋、β-折叠、延伸链以及无规卷曲组成,含有11个磷酸化位点。牦牛A-FABP基因编码的氨基酸序列与黄牛和水牛的同源性最高且都为97%,与其他物种的同源性也较高,说明在进化关系上A-FABP氨基酸序列较保守,此蛋白序列具Cytosolic fatty-acid binding家族蛋白功能结构域,无信号肽。

分类号： S823.85

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