贵州烟草上一株PVY坏死株系全序列测定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张帅

作者： 张帅;杨金广;王凤龙;钱玉梅;申莉莉;王永

作者机构：

关键词： 烟草;马铃薯Y病毒;全序列分析

期刊名称： 中国烟草科学

ISSN： 1007-5119

年卷期： 2011 年 32 卷 01 期

页码： 47-51

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 2007年从贵州省贵定烟区采集一株呈典型马铃薯Y病毒坏死株系(Potato virus Y vein necrosis strain,PVYN)的烟草病毒病样,经PVY鉴别寄主枸杞(Lycium barbarum L.)单斑分离纯化后,于枯斑三生烟(Samsun NN)株上保存,得到PVY分离物Guiding-3。以GenBank中已有的PVY全序列为基础,设计了3对PVY特异引物。通过总RNA提取、RT-PCR及序列测定,发现所测得的PVY分离物Guiding-3全长基因组序列(NCBI登录号为HM590405)包括9 699个碱基,整条序列仅包含一个由9 186个碱基组成的开放读码框(ORF),编码一条包含3 061个氨基酸的多聚蛋白。利用MEGA软件对所测得的PVY全序列与GenBank中已有的PVY全序列进行系统进化分析,发现Guiding-3分离物的序列与PVYN、PVYNTN、PVYN:O、PVYO、PVYNNP株系的一致性分别为98%、97%、94%、92%、85%,在已有的PVY株系中,Guiding-3分离物与PVYN株系具有较高的进化亲缘关系。另外,还对PVY的分子变异进行了初步讨论。

分类号： S435.72

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