低氧胁迫下鲢miR-17a-5p及其靶基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李晓晖

作者： 李晓晖;冯翠;王巧欣;邹桂伟;梁宏伟

作者机构：

关键词： 鲢;miR-17a-5p;低氧;双荧光素酶;靶基因;信号通路

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2023 年 47 卷 001 期

页码： 136-149

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究miR-17a-5p在鲢低氧胁迫下的功能,在前期鲢small RNA测序的基础上对鲢miR-17a-5p进行靶基因预测及功能富集分析,通过双荧光素酶活性验证其与HIF-1α的靶向关系,并检测低氧胁迫下miR-17a-5p和其靶基因在鲢肝脏、脑、心脏和鳃四个组织中的动态表达特征.结果显示,鲢miR-17a-5p在不同物种间高度保守,预测出381个miR-17a-5p的潜在靶基因显著富集在硫代谢、mTOR信号通路以及萜类骨架的生物合成3个KEGG信号通路上.miR-17a-5p可与HIF-1αmRNA的3′UTR结合,并降低HIF-1αmRNA水平,低氧胁迫下miR-17a-5p的表达呈下降趋势,而HIF-1α表达则呈上升趋势;3个显著富集KEGG通路中的11个miR-17a-5p潜在靶基因在低氧胁迫过程中的不同组织中的表达,尤其是肝脏中的表达,除SGK1外,均呈显著上升趋势.研究表明,低氧胁迫下鲢各组织中miR-17a-5p的表达下调减弱了其对靶基因的抑制作用,进而导致HIF-1α、ddit4和Lrp5等响应低氧胁迫的基因表达上调.本研究为低氧胁迫下鲢miRNA的表达与调控机制提供新见解,也为培育耐低氧的鲢新品系(种)提供了参考.

分类号： S965.113

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