基于全基因组水平的花生FAR1转录因子家族分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 赵小波

作者: 赵小波;李春娟;孙全喜;王奇;牟艺菲;王娟;苑翠玲;姜常松;单世华

作者机构:

关键词: 花生;FAR1转录因子;生物信息学

期刊名称: 花生学报

ISSN: 1002-4093

年卷期: 2024 年 53 卷 02 期

页码: 1-9

收录情况: 北大核心

摘要: FAR1是一类起源于转座子酶的转录因子,在光敏色素A(phyA)信号通路的启动中起到非常重要的作用。基于全基因组水平对其家族分析,可为深入研究FAR1基因在花生生长发育、逆境胁迫响应中的分子调控机理提供依据。本研究在花生基因组中共鉴定出60个FAR1基因,该转录因子家族成员分成3个亚组,Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ亚组中分别包含了21、20和19个花生FAR1蛋白。65%直系同源基因的Ka/Ks值小于0.5,这些基因结构稳定、较为保守,经历了较强的负选择作用。转录组数据分析发现,大部分FAR1基因在花生叶片中表达。本研究结果有助于了解花生FAR1基因家族的进化与功能,为下一步深入研究该基因家族的功能提供依据。

分类号: S565.2

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