西藏扎布耶盐碱湖细菌的多样性与分离菌株的生长特性
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陶宇杰
作者: 陶宇杰;舒志万;郭敏;高翔;王嵘;沈国平;韩睿;朱德锐
作者机构: 青海大学医学院基础医学研究中心;青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室
关键词: 扎布耶湖;细菌多样性;高通量测序;纯培养法;次级代谢物
期刊名称: 微生物学通报
ISSN: 0253-2654
年卷期: 2023 年 012 期
页码: 5286-5299
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【背景】扎布耶湖位于青藏高原地区,是以水体中富含高浓度CO32-、HCO3-和Na+为显著特性的盐碱湖,因其地理位置高寒、高海拔,人迹罕至,涉及该盐湖微生物的研究相对较少。【目的】系统探究湖水中细菌多样性和菌种资源等,发掘可利用的潜在菌种。【方法】采用Illumina测序16S rRNA基因V3-V4区分析扎布耶湖细菌的群落结构组成、物种多样性特征;采用纯培养筛选分离可培养细菌,明确分离菌株分类学地位、生长特性及产酸能力,同时测定分离菌株四氢嘧啶(ectoine)、吲哚乙酸(3-indoleaceticacid,IAA)和胞外聚合物(extracellularpolymericsubstances,EPS)的积聚量。【结果】Illumina测序明确分类地位的细菌有21门44纲86目583属,其中优势门类群是变形菌门(Proteobacteria,25.11%-67.60%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,4.84%-35.02%)和厚壁菌门(Firmicutes, 1.24%-11.01%),优势属类群是克雷伯氏菌属(Klebsiella, 0.01%-9.53%)、盐单胞菌属(Halomonas,0.54%-8.75%)、芽单胞菌属(Gemmatimonas,2.39%-6.00%)和腈基降解菌属(Nitriliruptor,1.27%-6.26%)。纯培养法筛选获得嗜盐碱菌38株,其中芽孢杆菌属(Bacillus)23株(60.53%)和盐单胞菌属(Halomonas) 10株(26.32%),菌株均具有耐盐碱和产酸能力(19.80%-29.68%)。大多数菌株能积聚四氢嘧啶、IAA和EPS,产量范围分别为1.36-175.59、0.27-8.69和0.02-0.22 g/g。【结论】扎布耶湖细菌群落结构与其他地区盐碱湖相似,但存在大量未明确分类学地位的细菌,分离菌株多具有耐盐碱及产酸特性。此外,还发现4株高效生产四氢嘧啶、3株生产吲哚乙酸和3株生产胞外聚合物的潜力菌株,为扎布耶盐湖微生物资源的开发利用奠定了基础。
分类号: Q938
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