绵羊MC4R基因的半定量RT-PCR及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张菊

作者: 张菊;杜立新;李宏滨;魏彩虹

作者机构:

关键词: 黑素皮质素受体-4;基因克隆;半定量RT-PCR;生物信息学

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2010 年 41 卷 07 期

页码: 804-810

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究旨在对绵羊MC4R基因进行组织表达谱和生物信息学分析。参考牛MC4R基因序列设计引物,采用PCR技术克隆绵羊MC4R基因序列,并利用半定量RT-PCR进行组织表达谱分析;同时对其进行生物信息学分析。结果表明,克隆的绵羊MC4R基因全长1 919 bp,含有999 bp的完整CDS编码区,编码332个氨基酸。其CDS编码区的核苷酸序列与牛、人、猪、大鼠、小鼠MC4R基因对应序列的同源性分别为95.2%、68.8%、82.7%、76.6%、77.1%,预测的氨基酸序列同源性分别为97.0%、92.8%、93.7%、92.2%、91.6%。组织表达谱分析表明MC4R基因在各组织均不同程度的表达,其中在大脑表达量很高,其他组织较低。生物信息学预测MC4R蛋白功能发现,绵羊的MC4R蛋白存在7个跨膜螺旋结构域,同时预测MC4R存在10个磷酸化位点和1个特异性蛋白激酶磷酸化位点。结果表明,MC4R是一个非常保守的蛋白,在绵羊的生长发育中起着重要作用。

分类号: S826

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