大薯病程相关蛋白1(PR1)基因及其启动子序列的克隆与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张青

作者： 张青;赵景梅;黄东益;肖鑫辉;夏薇;许云;黄小龙;吴文嫱

作者机构：

关键词： 大薯;病程相关蛋白1;启动子;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 07 期

页码： 2078-2084

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究大薯Da PR1基因的表达模式及调控机理,本研究利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,从高抗炭疽病大薯材料Da94中获得1个病程相关蛋白1(pathogensis-related protein 1,PR1)基因,命名为Da PR1。测序显示该基因包含长度为501 bp的完整开放阅读框(ORF),预测编码166个氨基酸。生物信息学分析表明该基因编码的蛋白具有典型SCP-PR1-like保守结构域,Blast比对表明Da PR1蛋白与多种植物的PR1蛋白高度同源。实时荧光定量PCR检测表明,Da PR1基因在高抗种质中受炭疽菌显著诱导,在侵染48 h时其相对表达量达到最大。通过巢式PCR扩增Da PR1上游转录调控序列的5'端,获得1 203 bp的Da PR1基因启动子,序列分析表明该区域除了含有基础的启动子元件CAAT-box和TATA-box外,还存在茉莉酸(JA)、赤霉素(GB)等激素响应元件及真菌诱导响应元件(W-box)。本研究通过克隆和分析Da PR1基因及其启动子序列,为进一步研究该基因的功能及其表达调控机制奠定了基础。

分类号： S436.32

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