西葫芦过氧化物酶POD1基因的分离及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 黄丽芳

作者： 黄丽芳;刘建汀;王彬;温庆放;朱海生;林碧英

作者机构：

关键词： 西葫芦;过氧化物酶;转录组测序;荧光定量PCR

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2018 年 09 期

页码： 943-949

收录情况： 北大核心

摘要： 通过西葫芦转录组测序,筛选得到1条功能注释为过氧化物酶(peroxidase,POD)的基因全长序列(c47620.graph_c0)。分析发现,该序列全长1 245bp,包含1个996bp的开放读码框(open reading frame,ORF),预测编码331个氨基酸,理论分子量(molecular weight,Mw)为35.70kDa,等电点(isoelectric point,pI)为5.40,编码的蛋白质与黄瓜、甜瓜和苦瓜等常见瓜果类蔬菜同源蛋白质的相似性在84%、84%和81%,显示其高度的保守性,基因命名为CpPOD1,GenBank登录号为MF988285。荧光定量PCR分析结果表明,CpPOD1基因具有组织表达特异性,在叶片中表达丰度最高,其次为根,在花中的表达最低。CpPOD1基因在低温弱光条件下,其表达量随时间增加而显著上调。初步推测,CpPOD1基因在西葫芦低温弱光胁迫下存在一定上调表达,猜测可能参与调控下游基因对低温弱光胁迫的响应有关。

分类号： S642.6

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