火龙果苯丙氨酸解氨酶(HuPAL)基因家族的全基因组鉴定及其对桃吉尔霉侵染的响应
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王宇
作者: 王宇;王恩权;方晓彤;张雪;王荔
作者机构:
关键词: 火龙果;苯丙氨酸解氨酶;全基因组;基因家族分析;表达分析;桃吉尔霉
期刊名称: 贵州农业科学
ISSN: 1001-3601
年卷期: 2025 年 53 卷 009 期
页码: 86-96
收录情况: 北大核心
摘要: 【目的】探明火龙果苯丙氨酸解氨酶(HuPAL)基因家族成员信息,解析其进化特征、序列性质、启动子元件、表达模式及对桃吉尔霉(Gilbertella persicaria)侵染的响应,为火龙果抗病育种及采后病害防控提供分子依据。【方法】基于火龙果全基因组数据,以Pfam结构域PF00221为参考,结合HMM扫描和BLAST比对从火龙果基因组中鉴定HuPALs成员;利用MAFFT、MEGA和Ortho Finder进行系统发育与直系同源分析;借助ProtParam、MEME、Batch-CD-Search和PlantCARE评估理化性质、保守基序、结构域及顺式作用元件;整合12个时期的转录组数据,利用针刺法接种G.persicaria,通过RT-qPCR验证基因表达,测定PAL酶活及关联反应。【结果】在红肉火龙果全基因组中共鉴定2个HuPALs基因(HuPAL1、HuPAL2),分别定位于Chr06与Chr09,序列长度714~725个氨基酸,分子量77.65~78.86 kDa。蛋白均呈酸性、亲水性且结构稳定;HuPALs与燕窝果同源PALs亲缘关系最近。启动子区富含激素、胁迫和组织特异元件,HuPAL1独有的Zeatin元件暗示其在细胞分裂分化、器官形成以及应对环境胁迫等多种生物学过程发挥调控作用。转录组显示,HuPAL1在花与果实发育阶段高表达,HuPAL2表达较低;病原侵染后HuPAL1出现“快速诱导-持续高表达”,驱动PAL酶活性由抑制转为恢复并减缓病斑扩展。【结论】HuPALs序列高度保守,但在调控层面呈现功能分化:HuPAL1兼具“发育-防御”双重作用,为火龙果抵御桃吉尔霉的核心基因;HuPAL2作为辅助型发挥协同作用。
分类号: S436.67
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