桑氧化固醇结合相关蛋白的基因克隆及序列与表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 师彗云
作者: 师彗云;王恒;赵卫国;胡兴明;尚亚君;刘利;邓文;叶楚华
作者机构: 湖北省农业科学院经济作物研究所;江苏科技大学生物技术学院
关键词: 桑树(Morus L.);氧化固醇结合蛋白相关蛋白;基因克隆;序列特征;基因表达
期刊名称: 湖北农业科学
ISSN: 0439-8114
年卷期: 2014 年 53 卷 24 期
页码: 6030-6037
收录情况: 北大核心
摘要: 氧化固醇结合蛋白家族是一类存在于真核生物中的能结合氧化固醇的保守蛋白,主要作用是参与细胞中的脂类代谢、囊泡运输及信号转导等方面。试验利用RT-PCR和RACE技术从桑树(Morus L.)鲁桑系品种育71-1(M.multicaulis Perr.cv.Yu 71-1)中克隆出一个氧化固醇结合蛋白相关蛋白基因,该c DNA全长1 974 bp,含有一个完整的全长1 371 bp的读码框(ORF),内有220 bp的5’非翻译区(5’UTR)和383 bp的3’非翻译区(3’UTR),3’端以Poly(A)15结束。其开放读码框共编码456个氨基酸,分子量为51.97 k D,等电点为5.143。利用Pfam和PROSITE在线分别进行了蛋白质的结构及功能位点和motif预测,结果显示,该蛋白为氧化固醇结合蛋白相关蛋白家族的成员,具有氧化固醇结合蛋白相关结构域,且含有该家族蛋白特有的极其保守的指纹基序"EQVSHHPP"。多重序列比对结果表明,该蛋白高度保守,在系统进化树中桑树与野草莓(Fragaria vesca subsp.vesca L.)、碧桃(Prunus persica Batsch.var.duplex Rehd.)等的亲缘关系较近。Real-time PCR分析表明,该基因在花、幼果、成熟果的表达量比根、茎和芽中的表达量要高。在高盐胁迫下,桑树Ma-acyin-ORP基因的表达量先升高、后下降,初步推断该基因可能参与某种压力胁迫的生理反应。
分类号: S888.2
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