基于SNP标记对嘉定白蚕豆遗传多样性与特异性的鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨华

作者： 杨华;陈珏;龙萍;王磊;韩静;邹丹蓉;夏辉

作者机构：

关键词： 嘉定白蚕豆;遗传多样性;遗传特异性;简化基因组测序;SNP标记

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2024 年 40 卷 006 期

页码： 1-8

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了在基因组水平上揭示嘉定白蚕豆的遗传特性,基于简化基因组测序技术,研究了嘉定白蚕豆种质的遗传多样性,及其与其他来源蚕豆种质的遗传差异,并利用检测到的SNP进行了主成分分析、聚类分析与群体遗传结构分析。结果表明:142份蚕豆种质资源中共检测到30 984个SNP。主成分分析可大致区分嘉定材料与其他材料,聚类分析将这142份材料划分为上海嘉定、上海其他和其他省份材料为主的三簇,而群体遗传结构分析则显著区分了嘉定材料与其他材料。从上述SNP中筛选了18个在嘉定和其他材料间存在高分化的SNP标记,均匀分布在6对染色体上,利用这些SNP可准确鉴定(准确率78%)嘉定白蚕豆核心材料。本研究可为嘉定白蚕豆种质资源的保护、研究和利用提供重要的技术支撑。

分类号： S643.6

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