建鲤FABP3基因分离及其多态性与增重的相关分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 俞菊华

作者： 俞菊华;李红霞;李建林;唐永凯;夏正龙;董在杰

作者机构：

关键词： 建鲤;心肌型胞内脂肪酸结合蛋白;单核苷酸多态性;SNP-增重相关分析

期刊名称： 水产学报

ISSN： 1000-0615

年卷期： 2012 年 36 卷 12 期

页码： 1809-1818

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为获得与建鲤增重相关的分子标记进行建鲤分子育种,实验在建鲤心肌型脂肪酸结合蛋白(FABP)基因上筛选了与增重相关的SNP位点。首先使用PCR扩增到2个建鲤FABP3基因,jlFABP3a和3b基因,两个基因均有4个外显子和3个内含子组成,3a和3b阅读框相似性为93%,编码133个氨基酸,相似性为94%,内含子长度和序列存在着明显差异。jlFABP3的系统进化和传统的分类地位一致。通过序列比对,在3a和3b上分别找到26和25个SNP位点。构建PCR-RFLP法检测了其中3个SNPs在建鲤群体中的分布,并与增重进行相关分析,结果显示,C30G与检测群体雌、雄鱼鱼种阶段和雌鱼成鱼阶段增重显著相关(P<0.05),CC型个体增重显著快于CG型个体。G267T在5个家系中与雌鱼成鱼增重相关,在7个家系中不同基因型个体增重虽呈相同趋势但差异不显著(P>0.05)。同时考虑G267T和C30G位点,则发现GGCC个体在雌、雄鱼增重均最大,在雌、雄鱼中分别比GGCG个体快17%和12%。GGCC个体在实验样本中占约9%,存在着较大的选育空间。

分类号： S917.4

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