半番鸭NMB基因克隆、生物信息学和组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张莹

作者： 张莹;陈广振;刘梅;李红霞;俞燕;贾雪波;李雯倩;范建华;马志禹

作者机构：

关键词： 半番鸭;NMB基因;克隆;表达;生物信息学

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2025 年 52 卷 004 期

页码： 1705-1715

收录情况： 北大核心

摘要： 【目的】本研究旨在克隆半番鸭神经介素B(NMB)基因并对其进行序列分析，检测NMB基因在半番鸭不同组织中的表达情况。【方法】根据NCBI数据库中鸭NMB基因的预测序列(登录号：XM＿027466185.2)设计引物，通过PCR扩增获得半番鸭NMB基因片段，克隆后测序获得NMB基因序列；利用生物信息学分析软件对半番鸭NMB核苷酸和氨基酸序列进行分析，并构建遗传进化树；通过实时荧光定量PCR检测NMB基因mRNA在半番鸭体内多个组织中的表达情况。【结果】本试验克隆获得了半番鸭NMB基因，其CDS序列长度为387 bp,编码128个氨基酸，包括14个氨基酸(GNLWATGHFMGKKS)的蛙皮素保守结构域，与鸡、小鼠、猪、牛和人的NMB的保守结构域完全相同。相似性比对发现，半番鸭与鸡NMB基因核苷酸和氨基酸序列的相似性较高，分别为87.9%和89.8%,与其他动物的相似性较低；半番鸭NMB在进化上与鸡亲缘关系较接近，与牛、马、猪、犬等家畜较远。生物信息学分析结果表明，半番鸭NMB蛋白属于亲水性蛋白，其N-端22个氨基酸为信号肽，二级结构和三级结构中α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲分别占53.91%、14.06%、7.03%和25.00%,半番鸭NMB蛋白主要与NMBR和GRPR蛋白结合发挥作用。实时荧光定量PCR结果显示，NMB基因mRNA在半番鸭中枢和外周多个组织器官中均有表达；以空肠为对照，NMB基因在中枢的小脑、大脑和视叶表达量相对较高(P<0.01),在外周的气管、肺脏、松果体、甲状腺、肾脏和尾脂腺表达量相对较高(P<0.01)。另外，NMB基因mRNA在不同性别半番鸭体内的表达趋势基本一致，但在在小脑和胰腺等组织中母鸭比公鸭NMB基因mRNA的表达量相对较高(P<0.01),但在松果体和肾脏等组织中则相反(P<0.01;P<0.05)。【结论】半番鸭NMB蛋白具有蛙皮素的保守结构域，与鸡的亲缘关系最近、蛋白相似性高，属于亲水性蛋白，有信号肽。NMB基因在半番鸭多个中枢(小脑、大脑和视叶)和外周(松果体、肾脏、尾脂腺、甲状腺和气管等)组织器官中高表达。以上结果可为进一步研究半番鸭NMB基因的功能提供参考。

分类号： S834.2

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