基于全基因组重测序和叶绿体DNA序列的河北魏县梨地方品种资源分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 齐丹
作者: 齐丹;董星光;李振江;曹玉芬;路露;田路明;李军喜;张莹;霍宏亮;苗秀晨;徐家玉;刘超;李金岭;朱蕊颖
作者机构:
关键词: 魏县梨;全基因组重测序;叶绿体DNA;亲缘关系
期刊名称: 果树学报
ISSN: 1009-9980
年卷期: 2025 年 42 卷 004 期
页码: 707-720
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】解析河北魏县梨地方品种的遗传背景,探讨魏县梨种质间的亲缘关系。【方法】以20个河北省魏县梨地方品种以及10个河北其他地区代表性梨地方品种为研究试材,基于全基因组重测序数据和叶绿体DNA变异信息开展河北魏县梨地方品种的分子鉴定。【结果】魏县梨地方品种具有明显的群体遗传结构,可分为两大类:类群1由魏县红梨等9份材料组成,与南方梨品种群亲缘关系较近,类群2由小白面等11份材料组成,更接近北方梨品种群。叶绿体DNA非编码区域的测序结果显示,在魏县梨地方品种中检测到3种较进化的单倍型,大部分地方品种的单倍型为H_3,魏县红梨的单倍型为H_2,雪花以及除金丰鸭梨外的鸭梨品种群的单倍型为H_1。分析品种间的亲缘关系和单倍型类别,鉴定金丰鸭梨并非鸭梨的芽变品种,可能为鸭梨的实生后代选育而成。白雪花不是雪花的芽变,白红梨不是魏县红梨的芽变,油秋与武安油秋两者的遗传背景存在显著差异,证实白砘子梨是砘子梨的芽变选育品种。【结论】明确魏县梨地方品种的亲缘关系和遗传背景,为魏县地方梨种质资源的保护和高效利用提供理论基础。
分类号: S661.2
- 相关文献
[1]从叶绿体DNA角度分析云南省砂梨地方品种遗传多样性. 齐丹,曹玉芬,田路明,董星光,张莹,霍宏亮,常耀军. 2016
[2]梨主栽品种叶绿体高变区accD-psaI的遗传多样性研究. 齐丹,曹玉芬,田路明,董星光,张莹,霍宏亮,常耀军,张小双. 2016
[3]基于重测序的不同生态型油梨的全基因组变异及进化分析. 葛宇,徐梓宁,马蔚红,刘远征,王步天,刘毅. 2022
[4]桃叶绿体全序列微卫星分布规律研究. 魏潇,章秋平,刘威生,杨巍. 2013
[5]分子生物技术在确定物种迁移后遗传变异中的应用. 沈禹颖,侯扶江. 2002
[6]茶树叶绿体DNA提取方法研究. 陈春梅,陈亮. 2014
[7]中国栽培稻及其近缘野生种叶绿体DNA的限制性片段长度. 肖晗,应存山,黄大年. 1996
[8]雷蒙德氏棉叶绿体基因组Fosmid文库构建. 李朋波,薛龙飞,王彦霞,张曦,李召虎,华金平. 2011
[9]苜蓿组培中叶绿体DNA和线粒体DNA的变异. 何启谦,刘新芝. 1994
[10]甘蔗叶绿体DNA的提取方法及其验证分析. 黄玉新,罗霆,周珊,高轶静,段维兴,杨翠芳,周会,张革民. 2014
[11]江淮流域杂草稻叶绿体DNA的籼粳分化. 杨杰,王军,曹卿,陈志德,汤陵华,王艳萍,方先文,王才林,仲维功. 2009
[12]基于叶绿体DNA变异的山荆子种质遗传多样性和系统演化. 高源,王大江,王昆,丛佩华,张彩霞,李连文,朴继成. 2020
[13]一种改良的水稻细胞质基因组制备方法. 万雯婷,董扬,于洋,李丽娟,张静. 2011
[14]苎麻叶绿体DNA的提取及分析. 郑建树,喻春明,陈平,王延周,谭龙涛,卢凌霄,陈继康,朱涛涛,熊和平. 2013
[15]非AA型野生稻叶绿体DNA籼粳特性研究. 邓华凤,陈良碧,何强,舒服,陈觉梁,袁隆平. 2007
[16]基于叶绿体DNA变异的湖北梨属种质系统进化及遗传多样性分析. 张靖国,曹玉芬,陈启亮,杨晓平,范净,田瑞,胡红菊. 2016
[17]香蕉叶绿体分离及叶绿体DNA提取方法. 龙兴,曾继吾,黄秉智,黄永红,易干军,陈金印,夏瑞. 2008
[18]基于叶绿体DNA 序列的Ceratotropis 亚属遗传进化研究. 刘岩,程须珍,王丽侠,王素华,白鹏. 2013
[19]植物细胞质雄性不育分子机理研究进展. 巩养仓,邢朝柱. 2006
[20]高粱细胞质雄性不育的分子遗传研究进展. 仪治本,梁小红,赵威军. 2005
作者其他论文 更多>>
-
不同处理方式对小麦胚芽贮藏稳定性及风味特征的影响
作者:邵子晗;龚勋;宋玉;陶澍;洪莹;刘超;朱佳琪;汪名春;曹磊;叶金侠;马凯旋
关键词:小麦胚芽;射频;脂肪氧化;α-维生素E;风味
-
半番鸭NMB基因克隆、生物信息学和组织表达分析
作者:张莹;陈广振;刘梅;李红霞;俞燕;贾雪波;李雯倩;范建华;马志禹
关键词:半番鸭;NMB基因;克隆;表达;生物信息学
-
晚熟梨新品种‘美香’
作者:李振江;李云峰;贾艳利;李小虎;申晓峰;王永博
关键词:梨;晚熟;品种
-
水禽主要疫病检测诊断技术研究进展
作者:范建华;吴发振;张莹;俞燕;程旭;赵宝华;韦玉勇;贾雪波
关键词:水禽;诊断检测方法;疾病防控
-
内蒙古不同地区奶牛产奶量及乳品质比较研究
作者:张莹;王丽芳;张腾龙;钟华晨;宋洁;郭晨阳;刘嘉琳
关键词:内蒙古;奶牛;产奶量;乳品质;比较研究
-
叶黄素合成关键基因及小麦生物强化研究展望
作者:庄文锋;黎飞飞;赵恒;周婷婷;刘超;孔令让;李安飞;杨猛
关键词:小麦;叶黄素;生物强化
-
环丙氟虫胺对蔬菜蓟马的室内毒力及田间药效评价
作者:张莹;刘航;袁江江;郑晓斌;王京;吴青君
关键词:环丙氟虫胺;间二酰胺类杀虫剂;蔬菜蓟马;室内毒力测定;田间药效