樱桃谷鸭源鹅出血性多瘤病毒(GHPV)全基因组克隆与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 万春和

作者： 万春和;陈翠腾;刘荣昌;程龙飞;施少华;傅光华;陈红梅;傅秋玲;黄瑜

作者机构：

关键词： 鹅出血性多瘤病毒(GHPV);樱桃谷鸭源;基因组;序列分析;遗传进化

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2018 年 26 卷 08 期

页码： 1410-1418

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 鹅出血性多瘤病毒(Goose hemorrhagic polyomavirus,GHPV)为近年来我国鸭群新发病原。为明确我国鸭源GHPV基因组特征,本研究利用分段PCR扩增技术克隆获得樱桃谷鸭(Anas platyrhynchos domestica)源GHPV(FJ201601株)全基因组序列,并对其进行核苷酸同源性比较和遗传进化分析。结果表明,克隆的GHPV(FJ201601株)全基因组序列长为5 254 bp(Gen Bank登录号MG544856),(G+C)%含量为48.01%,编码的6个主要功能基因(ORF-X,VP2,VP3,VP1,Large T和Small T)长度分别为510、981、654、1062、1 911和483 bp。核苷酸同源性分析表明,FJ201601株和其他不同地区、不同宿主来源GHPV相互之间基因组核苷酸同源性较高(99.7%以上);其6个主要功能基因和其他不同地区、不同宿主来源GHPV相应基因的核苷酸(99.4%以上)和氨基酸同源性(98.2%以上)均极高。从全基因组及其编码的6个主要功能基因遗传进化关系可见,GHPV各分离株在基因组上亲缘关系较近,6个主要功能基因在遗传进化上差异不大,但北京鸭源GHPV和樱桃谷鸭源GHPV在遗传进化上仍存在细微差别,且不同宿主(多品种鸭和鹅)源GHPV在遗传进化上不存在宿主特异性。本研究丰富了GHPV分子流行病学数据,明确了GHPV基因组分子特征,为后续开展GHPV相关研究提供参考。

分类号： S852.65

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