牦牛RPLP1基因克隆、生物信息学分析及组织表达规律分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张振宇

作者： 张振宇;王兴东;叶娜;姚喜喜;梁春年;阎萍;潘和平

作者机构：

关键词： 牦牛;RPLP1基因;克隆;组织表达

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2021 年 40 卷 009 期

页码： 3012-3018

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究牦牛酸性核糖体磷酸蛋白P1(RPLP1)基因结构与功能以及其在各个组织间的表达规律,本研究采用同源克隆和RT-PCR方法扩增牦牛RPLP1基因并获得全长序列,并对牦牛RPLP1的蛋白质结构和氨基酸序列进行生物信息学分析,然后提取青海大通牦牛心脏、肝脏、肺脏、脾脏、肾脏以及肌肉组织总RNA,利用RT-qPCR技术检测RPLP1基因在不同组织中的相对表达情况.RPLP1基因开放阅读框长度为345 bp,编码114个氨基酸,理论相对分子质量为28.4kD,等电点pI值为5.75,RPLP1蛋白的理化性质稳定,整条肽链呈疏水性,无信号肽,无跨膜区,主要在核糖体中发挥作用,该蛋白质二级结构主要由α螺旋(51.75%)、延伸链(9.65%)、无规卷曲(35.09%)组成;同源性比对结果显示,牦牛与普通牛亲缘关系最近;RT-qPCR结果显示,RPLP1基因在牦牛的7个组织中都参与表达,其在肌肉组织中的相对表达极显著高于其他组织(P<0.01).本研究为后期牦牛RPLP1基因的功能研究奠定了基础.

分类号： S823.85

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