芦花鸡HDAC9基因CDS区克隆、生物信息学分析及组织表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李欣

作者： 李欣;石一鸣;于永生;柳俭强;张琪;李文峰;吴伟东;张立春;赵中利

作者机构：

关键词： 芦花鸡;HDAC9;克隆;表达差异;生物信息学

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2023 年 59 卷 001 期

页码： 158-163

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探索组蛋白去乙酰化酶9(Histone Deacetylase 9,HDAC9)基因的功能,明确其在芦花鸡不同组织中的表达差异,实验采集芦花鸡各组织,克隆获得HDAC9基因完整CDS区,进行生物信息学分析及组织表达分析.结果显示,芦花鸡HDAC9基因CDS区长度为3210 bp,编码1069个氨基酸;芦花鸡HDAC9基因氨基酸序列与號鹦鹉、绿头鸭及雉鸡位于一个分支,同源性较高,亲缘关系较近.HDAC9蛋白分子质量约为118.0 ku,分子式为C5145H8261N1499O1613S33,理论等电点为6.33,半衰期为30 h,HDAC9蛋白为水溶性蛋白;HDAC9蛋白存在信号肽,为分泌蛋白;共存在67个潜在的磷酸化位点;存在3个N-糖基化潜在位点.HDAC9蛋白二级结构由α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规则卷曲组成,三级结构预测结果与其一致.实时荧光定量PCR结果显示,HDAC9基因在芦花鸡不同组织中表达水平存在显著差异,其中在胸肌中表达量最高,其次为睾丸.本实验结果为进一步探索HDAC9基因生物学功能奠定基础.

分类号： S831.2

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