新疆两典型微咸水湖水体免培养古菌多样性

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邓丽娟

作者： 邓丽娟;娄恺;曾军;徐赢华;史应武;张煜星

作者机构：

关键词： 微咸水湖;古菌;16S rRNA基因

期刊名称： 生态学报

ISSN： 1000-0933

年卷期： 2012 年 32 卷 21 期

页码： 6811-6818

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 微咸水湖是湖泊演化过程中的一个重要中间状态,以新疆两典型微咸水湖-赛里木湖和柴窝堡湖水为研究对象,采用微孔滤膜收集菌体,SDS-酚-氯仿抽提法直接提取湖水总DNA,利用古菌16S rRNA基因通用引物进行PCR扩增,分别构建两湖古菌16S rRNA基因克隆文库。用限制性内切酶HaeⅢ对随机挑选的阳性克隆子进行酶切分型,分别得到7个和8个可操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs),两文库覆盖率均大于98%。BLAST比对和系统发育分析表明赛里木湖全部克隆子归属于泉古菌门(Crenarchaeota),97%的克隆子与不同环境免培养氨氧化泉古菌有较高的序列相似性(>97%)。柴窝堡湖水古菌归为3个门:Thaumarchaeota(81.2%)、广古菌门(Euryarchaeota)(13%)和泉古菌门(Crenarchaeota)(5.8%),81.2%的克隆子与具有氮代谢功能的氨氧化古菌纯培养物具有较高的序列相似性(97%—98%),13%的克隆子与已分离到的产甲烷古菌序列同源性大于97%。研究发现新疆微咸水湖可能存有大量新划分的古菌Thaumarchaeota门类群、可培养氨氧化及产甲烷古菌类群,两典型微咸水湖泊中古菌类群多样性较低且群落组成差异大。

分类号： Q938.8

  • 相关文献

[1]铜胁迫对农田土壤酶活性、细菌和古菌数量的影响. 王斐,黄益宗,王小玲,高柱,余发新,徐峰,保琼莉,胡莹,乔敏. 2014

[2]模拟增雨对荒漠土壤古菌多样性的影响. 高莹,徐晓天,辛智鸣,吴波. 2020

[3]南海东北部珠江口盆地沉积物中古菌群落垂向分布研究. 陈烨,张玉,甄毓,米铁柱,贺惠,王勋功. 2017

[4]基于高通量测序研究青藏高原茶卡盐湖微生物多样性. 张欣,刘静,沈国平,龙启福,韩睿,朱德锐. 2017

[5]水生植物小叶满江红内生真菌与古菌的发现及基于高通量测序的群落组成分析. 陈坚,郑伟文,郑益平,陈彬,郑斯平,朱炳耀. 2019

[6]青海湖微生物群落的共生模式. 石晴,韩睿,邢江娃,李永臻,沈国平,永胜,朱德锐. 2019

[7]古菌、生命树和真核细胞的功能演化. 肖静,范陆,吴顶峰,徐雁冰,赖登训,William F.MARTIN,朱瑞新,张传伦. 2019

[8]金华猪和长白猪粪便微生物移植小鼠的肠道古菌结构分析. 肖英平,王军军,李天天,唐标,何祥祥,李开锋,杨华. 2017

[9]南海三沙永乐龙洞古菌群落结构与多样性特征. 甄毓,贺惠,傅亮,刘乾,毕乃双,杨作升. 2018

[10]DGGE揭示红壤稻田以产甲烷菌为主的稳定古菌群落结构特征. 施嘉骏,梁玉勇,李晴,Aadil Memon,程正新,熊焕保,马伟,邓子新. 2018

[11]转cry1Ab和epsps基因玉米C0030.3.5对土壤古菌丰度和多样性的影响. 王晶,王蕊,朱珂,修伟明,赵建宁,杨殿林,李刚,田秀平. 2017

[12]川皖地区浓香型白酒窖底泥微生物菌群的多样性分析. 李文芳,王海英,张文学,邓宇. 2013

[13]三种不同形态太岁所含古菌的结构研究. 王朝江,王世清. 2017

[14]一株兼性嗜冷产甲烷杆菌的分离与系统发育学分析. 杨丽丽,杨磊,马诗淳,邓宇,张辉. 2011

[15]粪草比对猪粪与稻草干发酵产沼气及古菌群落的影响. 齐利格娃,高文萱,杜连柱,梁军锋,孔德望,沈晨,张克强. 2018

[16]外源砷胁迫对两种土壤中细菌和古菌群落的影响. 王亚男,赵婧,杨小东,曾希柏. 2020

[17]金华猪回肠、结肠古菌结构及其与体脂沉积的相关性研究. 章啸君,肖英平,马灵燕,李景上,胡旭进,楼芳芳,屠平光,项云,杜喜忠. 2023

[18]水井坊窖底泥微生物群落结构的DGGE分析. 王海英,张文学,施思,范鏊,邓宇. 2012

[19]不同水分条件对玉米根际微生物群落的影响. 冯帅,刘小利,吴小丽,江世杰,周正富,张维,陈明,王劲,柯秀彬. 2017

[20]西藏米拉山土壤古茵16S rRNA及amoA基因多样性分析. 孟祥伟,茆振川,陈国华,杨宇红,谢丙炎. 2009

作者其他论文 更多>>

微信小程序