绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列测定和分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王丹阳

作者： 王丹阳;王予彤;于良斌;韩海斌;徐林波;崔艳伟;康爱国;庞红岩

作者机构：

关键词： 茧蜂科;优茧蜂亚科;绿眼赛茧蜂;线粒体基因组;系统发育

期刊名称： 昆虫学报

ISSN： 0454-6296

年卷期： 2020 年 008 期

页码： 1028-1038

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]测定绿眼赛茧蜂Zele chlorophthalmus线粒体基因组全序列,分析其基因组结构及茧蜂科(Braconidae)部分类群的系统发育关系.[方法]利用Illumina MiSeq二代测序技术对绿眼赛茧蜂的线粒体基因组进行测序,对基因组序列进行拼装、注释,分析其结构特点和碱基组成;基于22种茧蜂科昆虫的COX1蛋白编码基因序列,应用最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建系统发育树,分析绿眼赛茧蜂与茧蜂科其他昆虫的系统发育关系.[结果]绿眼赛茧蜂线粒体基因组全长16 661 bp(GenBank登录号:MG822749),包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因,共37个基因,以及1个控制区.线粒体基因组有明显的核苷酸组成的偏倚,AT偏正,GC偏负,其A+T含量为82.83%.基因排列顺序与推测的昆虫祖先的序列不完全一致,tRNA基因7处发生重排.13个蛋白质编码基因均以ATN为起始密码子,以TAA为终止密码子.在22个tRNA基因二级结构中,除tRNAHis(H)缺失TΨC环和tRNACys(C)仅剩二氢尿嘧啶(DHU)臂和反密码子臂外,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构.基于COX1蛋白编码序列的系统发育分析结果显示,与绿眼赛茧蜂亲缘关系最近的是同属于赛茧蜂属的雪跗赛茧蜂Z.niveitarsis.[结论]本研究首次获得绿眼赛茧蜂线粒体基因组全序列.结果表明绿眼赛茧蜂隶属于优茧蜂亚科(Euphorinae)赛茧蜂属,并支持赛茧蜂属的单系性.

分类号： S476.3

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