苦荞FtC4H基因克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 尹桂芳

作者： 尹桂芳;段迎;杨晓琳;蔡苏云;王艳青;卢文洁;孙道旺;贺润丽;王莉花

作者机构：

关键词： 苦荞;RT-PCR克隆;肉桂酸-4-羟基化酶;生物信息学分析;实时荧光定量PCR

期刊名称： 作物杂志

ISSN： 1001-7283

年卷期： 2022 年 01 期

页码： 77-83

收录情况： 北大核心

摘要： 克隆苦荞苯丙烷类物质代谢途径中的关键酶肉桂酸-4-羟基化酶基因(FtC4H),为进一步研究其功能奠定基础。以云荞1号和小米荞为材料,提取不同发育期果壳RNA,利用RT-PCR法克隆苦荞FtC4H基因,运用生物信息学分析FtC4H蛋白的特征,构建FtC4H蛋白系统进化树,分析其基因表达。结果表明,克隆的FtC4H基因序列包含1299bp完整的c DNA开放阅读框,编码432个氨基酸,为亲水性不稳定碱性蛋白,具有P450超家族保守域,不具有跨膜结构域,有丰富的二级结构,三级结构预测显示FtC4H与6vby.1.A的序列相似度高。系统进化分析结果表明,本研究克隆的FtC4H与已报道的苦荞其他C4H基因不同。qRT-PCR结果表明,FtC4H在小米荞的花和叶中相对表达量显著高于云荞1号。

分类号： S517

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