基于转录组信息的杜梨盐胁迫相关MYB转录因子鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李慧

作者： 李慧;张雨峰;李晓刚;王中华;常有宏;蔺经

作者机构：

关键词： 杜梨;盐胁迫;转录组;MYB转录因子;表达模式

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN：

年卷期： 2024 年 001 期

页码： 132-146

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： MYB（myeloblastosis）蛋白是植物中最大的转录因子家族之一，广泛参与植物逆境胁迫应答。到目前为止，对于同一物种不同耐盐能力生态型之间MYB家族的表达模式还没有系统的比较分析。本研究基于杜梨（Pyrus betulaefolia）耐盐单株和普通单株转录组测序（RNA-sequencing, RNA-Seq）数据，筛选鉴定杜梨盐胁迫前后差异表达MYB基因，进行保守结构域归类、染色体分布分析、亚细胞定位预测和系统进化树构建，检测盐胁迫后PbMYBs基因在杜梨不同耐盐性株系各器官中的表达情况。借助转录组分析工具，注释获得129个盐胁迫后差异表达的杜梨PbMYBs基因，根据其结构特性可分为3大类：1RMYB、R2R3-MYB和3R-MYB。杜梨15号染色体上分布的PbMYBs基因数目最多。构建系统进化树发现，杜梨MYB家族包括3个大类、23个亚类。亚细胞定位预测结果显示，42个PbMYBs转录因子定位于胞外，87个定位于细胞核中。基于转录组数据的基因表达模式分析表明，杜梨PbMYBs基因参与了不同器官应对盐胁迫的转录调控；荧光定量PCR证实，不同PbMYBs转录因子基因分别在杜梨根、茎或叶中受盐胁迫信号诱导表达水平上调或下调。上述结果为进一步研究杜梨MYB家族的基因结构和生物学功能提供相关资料。

分类号： S661.2

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