花生紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 杜普旋
作者: 杜普旋;刘浩;胡冬秀;陈小平;洪彦彬;李友国
作者机构:
关键词: 花生;紫色酸性磷酸酶;生物信息学;基因家族
期刊名称: 中国油料作物学报
ISSN: 1007-9084
年卷期: 2022 年 44 卷 003 期
页码: 522-531
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 紫色酸性磷酸酶(purple acid phosphatase,PAP)是一类金属磷酸酯酶,参与植物的磷素利用、碳代谢、细胞壁合成等多种生理功能,尤其是对磷缺乏的适应.本研究利用生物信息学手段在花生(Arachis hypogaea L.)全基因组水平上对PAP基因家族进行了鉴定,并对其系统进化关系、保守结构域、基因结构以及它们在22个组织中的表达模式进行了分析.结果表明:花生基因组中有39个AhPAP基因,氨基酸序列长度为205~905,等电点大多数都小于7,蛋白质C端均含有金属磷酸酶结构域.以花生、拟南芥、水稻、苜蓿共74个PAP蛋白构建的系统发育树可分为四组,每组中都含有来自不同物种的PAP,并没有因为物种差异而各自聚为一类.AhPAP基因家族中部分成员的表达具有组织特异性,arahy.P03NME、arahy.DAPS6C在根瘤中表达量最高,而它们在其他组织中表达量较低或未检测到表达.本研究为揭示AhPAP基因家族在花生中的生物学功能奠定了基础.
分类号: S565.2%Q785
- 相关文献
[1]辣椒紫色酸性磷酸酶基因家族的鉴定与表达特征. 程远,郭勤卫,郑佳秋,万红建. 2017
[2]花生AT-hook家族基因的生物信息学分析. 胡冬秀,刘浩,梁炫强,吴自明,方加海. 2021
[3]玉米FLA蛋白家族的生物信息学分析. 胡颖,陈亚波,宋群星. 2017
[4]基于转录组的荔枝GRF基因家族的鉴定及表达分析. 阮城城,胡福初,王祥和,吴凤芝,周文静,吴文碟,周瑞云,陈哲. 2021
[5]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023
[6]水稻中富含亮氨酸的重复序列和核苷酸结合位点(LRR-NBS)基因家族的生物信息学分析. 孙学辉,路铁刚,贾士荣,黄大昉. 2004
[7]棉花β-半乳糖苷酶基因家族的全基因组鉴定及分析. 曹晓聪,张朝军,苟浩琦,王小艳,乔凯凯,马启峰,张桂寅,范术丽. 2021
[8]可可泛素结合酶基因家族的生物信息学初步分析. 赵秋芳,董晨,决登伟,陈宏良,贾利强. 2016
[9]甜瓜CmVDAC基因家族的鉴定及转录分析. 任凯丽,孔维萍,唐桃霞,程鸿,杨永岗,苏永全,赵晓琴. 2023
[10]基因组水平上水稻受体激酶基因家族的生物信息学分析. 孙学辉,路铁刚,贾士荣,黄大昉. 2004
[11]芫荽NPR1-like家族全基因组鉴定及分析. 王葆生,庞杰,廉勇,刘晓蕊,扈顺,刘湘萍. 2022
[12]受棉铃虫诱导的棉花糖基转移酶UGT基因家族的生物信息学及表达分析. 玛依拉·玉素音,阳妮,徐海江,杨延龙,张大伟,李春平,石必显,赖成霞. 2023
[13]苹果WRKY基因家族生物信息学及表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,董庆龙,周宗山. 2015
[14]玉米KCS基因家族的生物信息学分析. 苏桂华,李春雷,于晓明,孙传波,孙志超,苏义臣. 2022
[15]马铃薯扩展蛋白基因家族的鉴定与表达分析. 理向阳,代丹丹,杨铁钢,郝西. 2017
[16]黄瓜扩展蛋白基因家族的鉴定与生物信息学分析. 郝西,理向阳,腊贵晓,代丹丹,杨铁钢. 2015
[17]小豆AUX/IAA基因家族全基因组鉴定及表达分析. 罗永坚,葛蓉,刘军,李清. 2022
[18]亚洲棉NF-YA基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 王园园,赵春月,孙润润,秦腾飞,张金宝,郑巨云,杨秋月,翟勇全,孙家良,王清连. 2021
[19]‘芙蓉李’糖转运蛋白家族基因鉴定及表达分析. 姜翠翠,方智振,周丹蓉,林炎娟,叶新福. 2022
[20]黄瓜DIR家族基因的全基因组鉴定及其表达分析. 张开京,何帅帅,贾利,胡玉超,杨德坤,陆晓民,张其安,严从生. 2023
作者其他论文 更多>>
-
神秘的昆虫猎手:蚁蛉
作者:刘浩
关键词:
-
花生荚果产量相关性状QTL定位与候选基因分析
作者:林伟津;郭泽佳;刘浩;李海芬;王润风;黄璐;余倩霞;陈小平;洪彦彬;李少雄;鲁清
关键词:花生;荚果;QTL;候选基因
-
中国规模乳品生产效率静动态特征与驱动因素分析
作者:余泽田;刘浩;王晶晶;彭华;董晓霞
关键词:乳制品;生产效率;DEA模型;Malmquist指数;Tobit模型
-
地理标志产品"科尔沁牛肉"与非地理标志西门塔尔牛肉及进口安格斯牛肉品质差异分析
作者:阳晓婷;刘楠;刘浩;李亚兰;包世俊;霍志刚;孙丽荣;赵燕
关键词:地理标志;科尔沁牛肉;营养品质
-
2017-2022年我国花生登记品种主要性状演变分析
作者:汪娅梅;谭家壮;吴小丽;陈少菜;宋昌艺;黄小妹;洪彦彬;鲁清
关键词:花生;登记品种;产量和农艺性状;高油酸;抗病性;演变分析
-
花生赤霉素3-β-双加氧酶(AhGA3ox)基因家族的全基因组鉴定及表达分析
作者:李海芬;鲁清;刘浩;温世杰;王润风;黄璐;陈小平;洪彦彬;梁炫强
关键词:花生;GA3ox;表达分析;生物信息学;功能分析
-
牛肉品质无损检测技术研究进展
作者:阳晓婷;刘浩;刘楠;孙丽荣;李亚兰;郄梦洁;赵姗姗;白璐;赵燕
关键词:牛肉;品质;无损检测;近红外光谱;拉曼光谱;高光谱成像;电子舌;电子鼻