巴西橡胶树PEPRK基因家族成员的鉴定和表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 肖小虎

作者： 肖小虎;隋金蕾;戚继艳;方永军;周斌辉;唐朝荣

作者机构：

关键词： 巴西橡胶树;PEPRK;基因家族;结构与进化;表达分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2017 年 38 卷 01 期

页码： 70-75

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： PEP羧化酶激酶相关激酶(PEP carboxylase kinase-related kinases,PEPRKs)是CDPK-Sn RK超家族的一员,目前对其生理功能尚不清楚。本研究以拟南芥和杨树的PEPRK序列作为探针,对橡胶树和其他5种植物(木薯、水稻、杨树、蓖麻和拟南芥)的基因组和转录组数据进行全面搜索,共鉴定得到25个PEPRK基因家族成员,其中包括5个橡胶树PEPRK基因,命名为Hb PEPRK1-5。序列分析发现橡胶树PEPRK和其他植物类似,在序列中部含有一个相对比较保守的激酶结构域,而两端的同源性相对较低。在基因结构和进化方面,PEPRK主要分为2个大的分支,相同分支的成员在结构域和内含子分布上更为相似,其中橡胶树和木薯PEPRK在进化上具有较近的亲缘关系。在基因的表达方面,Hb PEPRK1主要在稳定期的叶片中表达,Hb PEPRK2和Hb PEPRK5在树叶、树皮和胶乳中均有表达,Hb PEPRK4主要在种子中表达;另外,研究发现橡胶树PEPRK家族成员的表达还与叶片发育、乙烯利刺激、真菌侵染和低温胁迫具有一定的相关性。

分类号： S794.1

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