断奶仔猪肠道古菌菌群结构功能与腹泻的相关性研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 潘成麟

作者： 潘成麟;宋彤星;章啸君;楼芳芳;胡旭进;屠平光;肖英平;吕文涛

作者机构：

关键词： 断奶仔猪;腹泻;16S rRNA;古菌

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2024 年 51 卷 011 期

页码： 4755-4764

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】研究断奶仔猪肠道古菌菌群结构功能，分析古菌与断奶仔猪腹泻的相关性，为防治断奶仔猪腹泻提供理论依据。【方法】选取同批次24日龄健康断奶仔猪(H组)和腹泻断奶仔猪(D组)各32头，采集粪便后通过16S rRNA基因测序分析两组粪便样本古菌菌群结构，使用PICRUSt2软件预测肠道古菌功能，分析差异古菌与断奶仔猪腹泻的相关性。【结果】健康和腹泻断奶仔猪腹泻评分差异显著(P<0.05)。广古菌门(Euryarchaeota)、泉古菌门(Crenarchaeota)和奇古菌门(Thaumarchaeota)为健康和腹泻仔猪优势古菌菌门；健康仔猪优势菌属为甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)、Euryarchaeota＿norank和甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)。腹泻仔猪优势菌属为Euryarchaeota＿norank、甲烷八叠球菌属和甲烷短杆菌属。腹泻仔猪菌群多样性和丰富度高于健康仔猪，且健康和腹泻断奶仔猪的古菌菌群结构和功能差异显著(P<0.05),古菌菌群结构差异主要体现在甲烷八叠球菌属、Euryarchaeota＿norank、恐硫球菌属(Sulfophobococcus)、Nitrosarchaeum、热网菌属(Pyrodictium)等菌属上；古菌菌群功能差异主要体现在脂多糖的生物合成、氨基酸生物合成、抗原处理和表达等通路上。相关性分析发现，甲烷八叠球菌属、恐硫球菌属、Euryarchaeota＿norank、甲烷暖球菌属(Methanocaldococcus)、火球菌属、甲烷卵圆形菌属(Methanocalculus)和Nitrosarchaeum的相对丰度与断奶仔猪腹泻均显著相关(P<0.05)。【结论】健康和腹泻断奶仔猪肠道古菌菌群结构和功能存在显著差异，腹泻断奶仔猪Euryarchaeota＿norank相对丰度较高，而甲烷八叠球菌属相对丰度较低，Euryarchaeota＿norank、甲烷八叠球菌属和恐硫球菌属与断奶仔猪腹泻存在相关性。

分类号： S858.28

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