中国白梨PbSFBB 13-gamma基因的分子克隆与序列特征(英文)
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张琳
作者: 张琳;谭晓风;胡姣;乌云塔娜;袁德义
作者机构:
关键词: 白梨;配子体自交不亲和性;花粉S基因;S位点F-box基因;进化树
期刊名称: 林业科学
ISSN: 1001-7488
年卷期: 2009 年 45 卷 11 期
页码: 36-43
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 以5个已知S基因型的中国白梨品种为试材,设计分别对应于梨SFBB-alpha,SFBB-beta和SFBB-gamma基因的3对引物对这5个品种进行基因组PCR扩增。结果仅引物组合PSFBG-F/PSFBG-R从‘金花’(S13S18),‘金花四号’(S13S18)和‘鹅梨’(S13S34)中扩增出一约1300bp的条带,经回收、克隆、测序后,鉴定其为SFBB-gamma基因,命名为PbSFBB13-gamma(Pyrus bretschneideri SFBB13-gamma),GenBank登录号为EU081892。逆转录PCR结果表明PbSFBB13-gamma仅在花粉中特异表达;序列分析表明该基因不含内含子,编码区含1191个核苷酸,编码396个氨基酸,预测分子质量与等电点分别为45.4ku、4.63。PbSFBB13-gamma表现出典型的花粉SFB/SLF基因的基本结构特征,即1个F-box结构域及4个可变区;在推导氨基酸水平上,其与蔷薇科SFB/SLF基因的相似性为17.8%~97.7%。试验结果充分表明PbSFBB13-gamma应为花粉S基因的候选基因。选取蔷薇科34个SFB/SLF基因的全长氨基酸序列,构建进化树研究基因间的进化关系。结果表明,34个SFB/SLF基因形成2个亚科特异的类群,但不形成种特异的类群,其进化规律与蔷薇科S-RNase基因一致,即花粉SFB/SLF基因的形成也是在亚科形成之后、种形成之前。研究结果有助于从分子水平上揭示中国白梨的自交不亲和性机制。
分类号: S661.2
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