一种高效筛选Mx GTPase效应区SNP方法
文献类型: 中文期刊
第一作者: 尹春光
作者: 尹春光;秦宏伟;彭浩;王晓强;杜立新;赵桂苹
作者机构:
关键词: Mx;二次PCR-SSCP;GED区;SNP
期刊名称: 生物技术
ISSN: 1004-311X
年卷期: 2018 年 02 期
页码: 130-135
收录情况: 北大核心
摘要: [目的]建立高效检测家禽Mx功能区SNP方法 ,改进PCR SSCP。[方法]以引进品种和地方品种为研究对象,筛选引物,优化程序,通过二次PCR改进SSCP方法对Mx基因GTPase效应区SNP进行检测。[结果]SSCP检测引物分型检测及SNP分析,检测结果与测序一致。来航鸡检测到阳性结果,且PA检测的多态位点均由编码区A/G替换引起,济宁百日鸡和来航鸡两个群体PIC为0.2515和0.2628,呈低度多态。[结论]χ~2独立性检验位点基因频率和基因型频率呈Hardy-Weinberg平衡,不同品种间位点8(S631N)基因型分布差异极显著(P<0.01)。改进后的PCR SSCP高效经济简便,为高通量后期检测、新位点筛选奠定基础。
分类号: Q78`S831
- 相关文献
[1]中国部分地方鸡品种Mx基因部分区域多态性分析及表达研究. 尹春光,杜立新,赵桂平,魏彩虹,李宏滨,王晓强. 2009
[2]禽类抗病毒蛋白质—Mx蛋白. 尹春光,杜立新. 2007
[3]植物的单核苷酸多态性及其在作物遗传育种中的应用. 郝岗平,杨清,吴忠义,曹鸣庆,黄丛林. 2004
[4]草原红牛CAPN1基因第5外显子多态性与肉质性状的相关研究. 曹阳,牛春华,张国梁,金海国. 2009
[5]ARMS-PCR在水稻米香基因Fgr检测中的应用. 陈晓军,王敬东,殷延勃,马洪文,宋玉霞. 2011
[6]三疣梭子蟹线粒体基因组单核苷酸多态性. 赵莲,李志辉,张培,薛蓓,赖晓芳,高焕,阎斌伦. 2018
[7]三疣梭子蟹线粒体基因组SNP在增殖放流家系识别中的应用. 赵莲,李志辉,张培,薛蓓,赖晓芳,张庆起,高焕,阎斌伦. 2018
[8]SNP分子标记技术在经济甲壳动物中的应用进展. 赵莲,薛蓓,高焕,阎斌伦. 2017
[9]草原红牛改良群体H-FABP基因SNP及其与肉质性状的相关分析. 文力正,赵玉民,姜昊,张国梁,戴立胜,赵志辉,陈承祯,张嘉保. 2008
[10]斑点叉尾MSTN基因4个SNP位点及其与生长性状的相关性. 张世勇,王明华,钟立强,秦钦,潘建林,陈校辉,边文冀. 2017
[11]猪Toll样受体4基因SNPs功能分析. 杨秀芹,陈月婵,汪亮,李海涛,刘娣,关庆芝,付博. 2012
[12]绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因预测分析. 管毓渝,廖荣荣,王振,赵静,陈振亮,张哲,肖倩,孙浩,王起山. 2016
[13]斑点叉尾GHRH基因3个SNPs位点及其单倍型组合与生长性状的关联分析. 张世勇,钟立强,秦钦,王明华,潘建林. 2016
[14]新疆绵羊SNP数据库系统的设计与实现. 罗鹏,张太红,贺三刚,朱先凤. 2014
[15]牛DES基因的SNPs检测. 狄江,Cynthia DK Bottema,Bozena Kruk. 2004
[16]蒺藜苜蓿、天蓝苜蓿、金花菜基因组SNP穿梭标记开发. 任海龙,魏臻武,陈祥. 2017
[17]建鲤IGFBP1基因的克隆及与增重相关的SNP位点分析. 魏可鹏,俞菊华,李红霞,李建林,唐永凯,夏正龙. 2012
[18]基于复合EST-SSR标记的大白菜种子纯度鉴定及SNP位点获取. 赵新,王永,兰青阔,贺长征,陈锐,李欧静,刘娜,朱珠,郭永泽. 2013
[19]猪CD8B表达谱、基因多态性及其与血液免疫性状的关联分析. 许金根,王重龙,车传燕,蔡治华,李升和,张勤. 2016
[20]鸡脂肪酸脱氢酶基因多态性及其与脂肪酸含量的关联分析. 刘向萍,雷黎立,周琼,王克华,常国斌. 2010
作者其他论文 更多>>
-
基于全基因组关联分析揭示肉鸡腿病发生的遗传机制
作者:唐鑫鑫;郑炬梅;骆娜;营凡;朱丹;李森;刘大伟;安炳星;文杰;赵桂苹;李和刚
关键词:白羽肉鸡;腿病;全基因组关联分析;候选基因
-
肠道微生物对家禽抗病力的影响研究进展
作者:李想;王巧;李庆贺;文杰;赵桂苹
关键词:家禽;肠道微生物;抗病
-
肉鸡屠宰性状全基因组关联分析
作者:王一东;陈智武;黄超;粟永春;余洋;崔焕先;郑麦青;赵桂苹;文杰;王述柏
关键词:肉鸡;屠宰性状;全基因组关联分析;单核苷酸多态性
-
全基因关联分析筛选文昌鸡体尺性状相关分子标记
作者:骆娜;安炳星;魏立民;文杰;赵桂苹
关键词:全基因组关联分析;鸡;体尺性状;胫长;胫围
-
植物单宁的生物学功能及其在畜禽生产中的应用研究进展
作者:李想;孙瑞萍;刘圈炜;欧阳坤;谢娅立;齐琪;赵桂苹;王秀萍;巩元芳;魏立民
关键词:植物单宁;畜禽;抗氧化活性;抑菌;生产性能
-
暹罗芽孢杆菌挥发性物质拮抗下烟草赤星病菌转录组分析
作者:李艺池;梁金昌;韦承建;王东坤;王卫民;陈勇华;宋光龙;胡希好;程德杰;任广伟;王晓强
关键词:暹罗芽孢杆菌;链格孢菌;挥发性有机化合物;转录组分析
-
磁珠法提取鸡血液基因组DNA效果研究
作者:王希彩;白露;孙嘉宏;谭晓冬;李韦;孔富丽;赵桂苹;文杰;刘冉冉
关键词:鸡;磁珠法;血液DNA;提取