乌拉尔图小麦全基因组NBS-SSR位点分析及标记开发

文献类型： 中文期刊

第一作者： 乔麟轶

作者： 乔麟轶;畅志坚;张晓军;刘静;朱艳;詹海仙;郭慧娟;李欣

作者机构：

关键词： 乌拉尔图小麦;NBS类基因;SSR标记;抗病

期刊名称： 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-8151

年卷期： 2017 年 37 卷 03 期

页码： 153-157

摘要： [目的]本研究旨在诊断乌拉尔图小麦NBS家族所在基因组序列的SSR位点,并为抗源的发掘和利用开发分子标记。[方法]利用NBS隐马模型文件检索数据库获得目标序列,通过软件诊断序列SSR位点并开发标记,利用乌拉尔图小麦抗白粉病材料UR207和感病材料UR203进行标记验证。[结果]本研究从乌拉尔图小麦全基因组中分离出463个NBS基因,分为N、CN、NL和CNL共4类。从NBS所在scaffold序列上发现4 292个SSR位点,以二碱基重复位点最多,占78.1%。随机开发了42个分布于各染色体臂的TuNBS-SSR标记,有12个标记在UR207和UR203间存在多态性。[结论]本研究从乌拉尔图小麦全基因组中诊断出4 292个NBS-SSR位点,开发的12个标记在抗感材料间有多态性,可用于乌拉尔图小麦材料抗病性鉴定和抗病基因筛选。

分类号： S512.1

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