奶牛pIgR基因5′侧翼区SNP检测及其与IgA和IgM含量的相关性研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张春刚

作者： 张春刚;王加启;卜登攀;刘光磊;程金波;董晓丽;赵国琦;魏宏阳;周凌云;刘开朗

作者机构：

关键词： 奶牛;pIgR基因;IgA和IgM;SNP;单倍型

期刊名称： 中国农业大学学报

ISSN： 1007-4333

年卷期： 2008 年 13 卷 04 期

页码： 63-70

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本试验研究了pIgR基因5′侧翼区的多态性及其对IgA和IgM含量的影响。从NCBI上的Map Viewer数据库下载牛pIgR基因的5′侧翼区的序列(NW_174143),长度为3.2 kb,设计4对引物进行PCR扩增,通过对25头奶牛的PCR产物直接测序发现并确定SNP位点,并用SNP Stream标签微列阵基因分型系统对189头牛进行基因分型,将其与牛奶和血液中的IgA和IgM的含量进行关联分析。结果表明,pIgR基因在-3128、-3072、-2834、-2348和-515位发现了5个SNP位点,其中SNP1和SNP2为A/G突变,SNP3、SNP4和SNP5为T/C突变。方差分析结果表明,SNP1对牛奶IgM和血液IgA含量有显着的影响(P<0.05),SNP3和SNP5对血液IgM含量有显着影响(P<0.05),其他SNP位点与单倍型组合对乳及血液中IgA和IgM的含量均没有显著影响(P<0.05);多重比较分析表明,SNP1位点的基因型AB个体与BB个体的牛奶IgM和血液IgA含量的最小二乘均数差异显著(P<0.05),SNP3和SNP5的不同基因型对血液IgM含量的最小二乘均数分别达到了显著水平(P<0.05)。因此得出,牛pIgR基因5′侧翼区的多态性影响牛奶和血液中的IgA和IgM的含量,这为进一步研究牛奶中IgA和IgM分泌转运机理提供了理论依据。

分类号： S823

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