基于金针菇全基因组的赖氨酸合成途径关键酶分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘建雨

作者： 刘建雨;王瑞娟;张丹;尚晓冬;谭琦

作者机构：

关键词： 金针菇;赖氨酸生物合成;α-氨基己二酸途径

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2016 年 43 卷 10 期

页码： 2225-2233

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】以金针菇全基因组测序数据为基础研究其L-赖氨酸的从头合成途径及其关键基因。【方法】采用Illumina Hiseq2000和Roche454 FLX+两种方法完成金针菇单孢菌株Dan3的基因组测序,基于全基因组序列筛选金针菇中赖氨酸生物合成的关键基因,并分析这些基因编码的蛋白质基本理化性质;预测其亚细胞定位情况及蛋白的二级结构。【结果】金针菇Dan3全基因组序列长度为34.17 Mb,预测到8个参与α-氨基己二酸途径的关键基因,这些基因都含有多个内含子和外显子,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,有3个蛋白定位于线粒体。【结论】金针菇是通过α-氨基己二酸途径合成赖氨酸,基因组中预测到与该途径相关的几乎所有的酶。

分类号： S646.15

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