4种犬科动物黑素皮质激素受体1基因序列比对及遗传进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐超

作者： 徐超;宋兴超;岳志刚;李光玉;赵蒙;赵伟刚;魏海军;赵家平

作者机构：

关键词： 犬科动物;黑素皮质激素受体1;序列比对;遗传进化

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2014 年 41 卷 01 期

页码： 25-29

收录情况： 北大核心

摘要： 基于GenBank中已公布的家犬(Canis familiaris)、赤狐(Vulpes vulpes)、北极狐(Alopex lagopus)和貉(Nyctereutes procyonoides)黑素皮质激素受体1(MC1R)基因序列,利用BioEdit 7.0等生物信息软件,对4种犬科动物MC1R基因进行序列比对和遗传进化分析。结果表明,家犬、赤狐、北极狐及貉MC1R基因为单一外显子,编码区序列长度均为954bp,碱基组成表现为C>G>T>A,且G+C百分含量高于A+T;编码区碱基序列中共检测到20个突变位点,包括16个单一突变和4个简约突变,转换类型多于颠换,核苷酸和氨基酸序列同源性较高;赤狐与北极狐间的遗传距离最短,邻近法(NJ)、最小进化法(ME)和非对组算数平均法(UPGMA)3种方法构建的进化树基本一致,赤狐与北极狐首先聚为一簇,貉比家犬、赤狐和北极狐分化时间更早。

分类号： Q75

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