猪传染性胃肠炎病毒福建株M基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 朱晓琳

作者： 朱晓琳;王劭;陈少莺;林锋强;程晓霞;陈仕龙;朱小丽;李兆龙

作者机构：

关键词： 猪传染性胃肠炎病毒;M基因;克隆;生物信息学

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2011 年 26 卷 06 期

页码： 13-17

摘要： 对猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)福建分离株(TGEV-FJ株)M基因进行克隆、测序,并利用生物信息学技术分析TGEV-FJ株M蛋白基因的同源性、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点及其二级结构。结果显示,成功扩增出M基因完整目的片段(789bp),编码262个氨基酸,构建了M基因的克隆重组质粒pGEM-T-M。序列分析与遗传进化树显示,TGEV M基因属高度保守的基因,TGEV-FJ株与HN2002株亲缘较近。TGEV-FJ株M蛋白具有一个潜在信号肽剪切位点(ACG16-17 ER),存在3个潜在的N-糖基化位点,丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点分别有6个、1个和5个;TGEV-FJ株M蛋白二级结构α-螺旋区域占11.59%,β-折叠区域占44.93%,无规则卷曲区域占43.48%。

分类号： S852.65

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