鳙基于10个微卫星标记的亲子鉴定分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 张丹
作者: 张丹;傅建军;张利德;方敏;朱文彬;王兰梅;苏胜彦;董在杰
作者机构:
关键词: 鳙;微卫星;亲子鉴定;家系选育
期刊名称: 基因组学与应用生物学
ISSN: 1674-568X
年卷期: 2019 年 07 期
页码: 2949-2957
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为开展鳙(Hypophthalmichthys nobilis)家系选育工作,本研究进行了基于微卫星标记的亲子鉴定研究。试验中筛选了10个扩增效率较高的微卫星标记,通过引物荧光修饰,引物结合毛细管电泳分型技术,对鳙48尾亲本及384尾子代进行了基因分型,并计算了等位基因频率和模拟分析和亲子鉴定等分析。结果发现,各位点的等位基因数介于4~13之间,其中9个位点均具有较高的多态性和杂合度(PIC>0.5, He>0.5),研究发现位点的多态性信息含量(PIC)与亲本对排除率(E-PP)存在显著正相关(p<0.01)。模拟分析结果显示,该10个标记预计可用于已知性别的50组亲本(100尾)或未知性别的50尾亲本的鉴定分析(鉴别成功率>95%)。亲子鉴定发现,对试验中2个交配组(每组12对亲本)的鉴别成功率分别为98.96%和100%;且父母本对子代的贡献率存在极显著差异(p<0.01)。通过累积位点的鉴定分析发现,当标记数为7个和9个时分别能满足试验中12组和24组亲本对应子代的鉴定分析(鉴别率>95%),模拟分析和亲子鉴定分析成功率趋势基本符合。本研究所开发的亲子鉴定技术可为鳙家系选育提供技术支持。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]合浦珠母贝选育家系的遗传多样性分析. 范嗣刚,王婧璇,黄桂菊,刘宝锁,郭奕惠,喻达辉. 2016
[2]微卫星分子标记辅助镜鲤家系构建. 鲁翠云,曹顶臣,孙效文,梁利群. 2008
[3]长江下游鳙放流群体和天然捕捞群体遗传多样性的微卫星分析. 张敏莹,刘凯,徐东坡,段金荣,周彦锋,方第安,施炜纲. 2013
[4]鲢鳙杂种亲本连锁图标记加密和共线性比较. 张立楠,杨官品,邹桂伟,危起伟,王军,张鹏,刘昕,杨静. 2011
[5]应用微卫星DNA标记分析荷斯坦母牛系谱可靠性及影响因素. 初芹,张毅,孙东晓,俞英,王雅春,张沅. 2011
[6]多倍体中华鲟微卫星亲子鉴定体系的建立. 辛苗苗,张书环,汪登强,汪珂,张磊,霍来江,危起伟. 2015
[7]微卫星DNA标记在番茄亲子鉴定中的应用. 姚祝平,叶青静,王荣青,阮美颖,周国治,万红建,杨悦俭. 2011
[8]黄鳍棘鲷家系亲缘关系鉴定. 朱克诚,宋岭,刘宝锁,郭华阳,郭梁,张楠,张殿昌. 2020
[9]基于微卫星标记的花鲈亲子鉴定技术. 范嗣刚,黄皓,王鹏飞,赵超,闫路路,邱丽华. 2023
[10]人工控制自然交尾条件下中国对虾父本的微卫星识别. 高焕,孔杰,于飞,王伟继,罗坤,孟宪红,刘萍,张天时. 2007
[11]基于微卫星多重PCR的黄鳝亲子鉴定技术. 鲁弘毅,田海峰,胡乔木,李忠. 2023
[12]单核苷酸多态性标记在牛亲子鉴定中的应用与展望. 李东,初芹,王雅春. 2011
[13]内蒙古地区西门塔尔牛亲子鉴定微卫星标记筛选. 宋玲,贺建宁,孙东晓,李俊雅,张沅. 2011
[14]大菱鲆亲子鉴定的微卫星多重PCR技术建立及应用. 苗贵东,杜民,杨景峰,徐营,樊廷俊,陈松林. 2011
[15]基于微卫星多重PCR技术的长鳍吻鮈亲子鉴定. 陈亮,汪登强,何勇凤,吴兴兵,朱永久,朱挺兵,王亚龙,杨德国. 2017
[16]微卫星标记及其在动物亲缘关系鉴定中的应用. 张正义,邢秀梅,胡鹏飞,刘松啸,董依萌,鞠贵春. 2018
[17]基于微卫星标记的圆口铜鱼亲子鉴定技术. 何勇凤,朱永久,吴兴兵,龚进玲,杨德国. 2019
[18]哲罗鱼微卫星亲子鉴定的应用. 张春雷,佟广香,匡友谊,张超,尹家胜. 2010
[19]福瑞鲤选育家系不同养殖阶段的生长差异分析. 王兰梅,朱文彬,董在杰,苏胜彦,傅建军,阎明信,刘念. 2017
[20]基因组选择技术在半滑舌鳎"鳎优1号"新品种培育中的应用研究. 卢昇,李仰真,王磊,刘洋,程向明,周茜,杨英明,郑卫卫,陈松林. 2022
作者其他论文 更多>>
-
土壤消毒对连作苹果园土壤细菌群落结构的影响
作者:张丹;杨光柱;黄文静;唐昕;黄国嫣;郑丽萍;李云国;龚占斌;王斌;李帆;马钧;全勇
关键词:土壤消毒;苹果连作障碍;石硫合剂;土壤细菌
-
高产广适专用型小麦新品种郑麦0926的选育及提质增效栽培技术
作者:张丹;相志国;李金仓;赵献林;杨红珊;赵永英
关键词:小麦;郑麦0926;选育;特征特性;栽培技术
-
一株野生香菇与'申香215'孢子单核体杂交后代表型多样性分析
作者:徐蒋振;李洁;张帅;董浩然;邵阳浩;章炉军;张丹;宋春艳
关键词:香菇;野生种质;孢子单核体;交配型;多样性;农艺性状
-
香菇菌落角变菌丝生长情况及分析
作者:张丹;徐蒋振;董浩然;万佳宁;谭琦;宋春艳
关键词:香菇;菌落角变;木质纤维素降解酶;ROS;基因组重测序
-
鳙体型差异个体转录组与miRNA的联合分析
作者:邓玉婕;朱文彬;傅建军;罗明坤;王兰梅;梁政远;董在杰
关键词:鳙;体型;骨骼发育;差异表达基因;差异表达miRNA
-
异龙湖区浅层地下水NO3--N浓度时空变化及其来源解析
作者:蒋存征;陈安强;胡万里;付斌;朱林立;刘云娥;黎明琦;王炽;张丹
关键词:浅层地下水;硝酸盐来源;同位素;时空变化
-
鳙长江中下游群体的D-loop序列遗传分析
作者:傅建军;朱文彬;罗明坤;王兰梅;董在杰
关键词:鳙;线粒体DNA;D-loop序列;种群多样性;遗传分化