鸡microRNA基因“seed”区4个SNPs的群体遗传分布

文献类型: 中文期刊

第一作者: 耿立英

作者: 耿立英;张传生;尹春光;曹顶国;付志新

作者机构:

关键词: 鸡;MicroRNA;seed;单核苷酸多态;遗传变异

期刊名称: 天津农业科学

ISSN: 1006-6500

年卷期: 2011 年 17 卷 01 期

页码: 100-105

摘要: 采用CRS-RFLP技术研究了rs14076349、rs16681032、rs14934924和rs16681031共4个SNPs位点在蛋肉兼用型、蛋用型和药用观赏型3种经济类型的6个鸡群的遗传多样性。结果表明:rs16681032在所有鸡群中未检测到变异,rs16681031、rs14934924和rs14076349位点具有较高的次等位基因频率,分别为0.4553、0.1173和0.3296。兼用型鸡与药用观赏型鸡在rs16681031位点的基因频率分布差异显著(P<0.05);兼用型鸡与蛋用型鸡在rs14934924位点的基因频率分布差异极显著(P<0.01);rs14076349位点在所有经济类群间的基因频率分布差异极显著(P<0.01)。根据基因频率信息进行聚类分析,大致可将6个鸡群分为3类,聚类结果反映出不同鸡种microRNAs调控通路的差异。研究结果表明,鸡种系特异性microRNA基因可能受到正选择的影响而存在加速进化现象,其"seed"区SNPs位点在不同鸡种的经济表型的形成中可能发挥着重要作用。

分类号: S831.2

  • 相关文献

[1]鸡mir-1644基因“seed”区的T>C多态分析. 耿立英,张传生,尹春光,曹顶国,杜立新,陈娟. 2011

[2]核受体辅激活蛋白1基因(NCOA1)作为鸡产蛋性状候选基因的研究. 黎寿丰,赵振华,黄华云,张静,丁余荣. 2010

[3]NPY基因SNPs与鸡屠体性状的关联分析. 周卫东,杨菲菲,宋雪梅,姜俊芳,邵涛. 2009

[4]ESR、NPY基因对文昌鸡繁殖性状的遗传效应分析. 于吉英,陈宽维,肖小君,李慧芳,朱文奇. 2008

[5]鸡球虫抗药株遗传学变异和蛋白质差异表达研究进展. 薛方民,米荣升,安利国,陈兆国. 2007

[6]中国美利奴羊多胎品系选育中多胎性状分离与BMPR-IB基因型的相关性分析. 杨华,张永胜,何其宏,王建华,杨永林,钟发刚,王新华,刘守仁. 2009

[7]母猪FcRn基因多态性及其对初乳中IgG含量的影响. 王炳艳,王立贤,王婷,翟丽维,王楚端,李振宽,周伟良. 2007

[8]基于重测序的大豆新品种齐黄34的全基因组变异挖掘. 张彦威,李伟,张礼凤,王彩洁,戴海英,徐冉. 2016

[9]猪RBP1和RBP4基因的定位、组织表达谱和多态性. 公维华,唐中林,崔文涛,杨述林,李奎. 2007

[10]三倍体香蕉优良品种‘Grand Nain’全基因组变异挖掘. 邵秀红,胡春华,盛鸥,毕方铖,邓贵明,杨乔松,易干军. 2018

[11]绵羊产羔性状主效基因检测研究. 王启贵,钟发刚,李辉,王新华,刘守仁,陈晓军,甘尚泉. 2005

[12]扩增子测序结合高分辨率溶解曲线鉴定花生单核苷酸多态. 刘颖,朱方何,洪彦彬,刘洪. 2015

[13]绵羊BMPR-IB基因多态性与其产羔数的相关研究. 王启贵,钟发刚,李辉,王新华,刘守仁,陈晓军. 2003

[14]鸡基因组pre-microRNASNP多态性. 耿立英,张传生,杜立新. 2009

[15]鸡基因组pre-microRNA SNP多态性. 耿立英,张传生,杜立新. 2009

[16]苏尼特羊拷贝数变异的基因组分布特征研究. 刘佳森,张莉,李蕴华,赵福平,魏彩虹,杜立新. 2013

[17]猪RBP2和CRABP2基因的定位、组织表达谱分析、单核苷酸多态性研究及其关联分析. 公维华,唐中林,杨述林,崔文涛,李奎. 2007

[18]绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因预测分析. 管毓渝,廖荣荣,王振,赵静,陈振亮,张哲,肖倩,孙浩,王起山. 2016

[19]microRNA在植物生长发育中的作用. 刘海丽,丁艳菲,潘家荣,江琼,王光钺,朱诚. 2013

[20]水稻(Oryza sativa L.)愈伤组织发育过程中Auxin-miR167-ARF8信号通路的研究. 淳俊,王文国,王胜华,陈放. 2013

作者其他论文 更多>>