群结腐霉细胞壁降解酶的活性检测及基因表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 陈一帆
作者: 陈一帆;薛太强;陈思桥;张金凤;周冬梅;魏利辉
作者机构:
关键词: 群结腐霉;植物细胞壁降解酶;转录组;酶活
期刊名称: 江苏农业科学
ISSN: 1002-1302
年卷期: 2023 年 51 卷 004 期
页码: 46-51
收录情况: 北大核心
摘要: 群结腐霉(Pythium myriotylum)是一种死体营养型病原菌,可侵染生姜引起茎基腐病,造成生姜产量损失,严重危害该产业发展.群结腐霉含有大量植物细胞壁降解酶(plant cell wall-degrading enzymes,PCWDEs),然而PCWDEs在群结腐霉侵染生姜过程中的功能和特性却鲜有报道.运用生物信息学手段预测群结腐霉细胞壁降解酶的种类和数量,并以生姜粉末和葡萄糖为碳源,比较菌丝生长的情况,利用转录组分析比较PCWDEs基因在不同碳源条件下的表达差异情况,同时对培养液中主要PCWDEs进行酶活检测.转录组数据显示,与葡萄糖培养基相比,生长在生姜粉末培养基上的群结腐霉中12个PCWDEs编码基因显著上调表达,利用CAZymes网站预测PCWDEs的底物主要为淀粉和纤维素;酶活检测发现,其中α-葡萄糖苷酶和β-葡萄糖苷酶活性较高,分别降解淀粉和纤维素.结果表明,群结腐霉在生姜粉末上生长过程中的PCWDEs以淀粉降解酶和纤维素降解酶为主.
分类号: S436.32
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