黄瓜核心种质白粉病抗性的全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 贾会霞

作者： 贾会霞;李锡香;宋江萍;林毓娥;张晓辉;邱杨;阳文龙;娄群峰;王海平

作者机构：

关键词： 黄瓜;白粉病;全基因组关联分析;单核苷酸多态性;候选基因

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2021 年 007 期

页码： 1371-1385

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以231份来自世界各地的黄瓜核心种质为材料,于2017和2018年在北京和广州进行白粉病抗性鉴定,利用基因组重测序检测的950 382个SNPs进行全基因组关联分析。结果表明,黄瓜白粉病在广州地区的自然发病率显著高于北京地区,不同种质在两年病情指数（DI）之间存在较高的相关性;基于混合线性模型,共检测到12个显著关联信号,分布于1号、5号和6号染色体上,其中,pm1.1在北京的两年中被重复检测到,pm5.7在广州的两年中被重复检测到;显著关联信号中共有68个超过阈值[–log10（P value）=6.0]的SNP,包含1个外显子区非同义突变SNP（Chr5:16 676 542）,位于编码异嗜性和多嗜性逆转录病毒受体蛋白基因XPR（Csa5G471600）上;在与白粉病抗性相关联SNP的LD区段内共检测到63个候选基因,其中7个候选基因的表达量在高抗材料接种白粉病前后出现显著差异。

分类号： S642.2

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