山羊IL15RA基因突变位点鉴定及其与生长性状的关联性
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王本治
作者: 王本治;王翱;吴贤锋;徐倩;李文杨;甘乾福;肖天放;刘远
作者机构:
关键词: 山羊;IL15RA基因;单核苷酸多态性;生长发育;关联分析
期刊名称: 福建农业学报
ISSN: 1008-0384
年卷期: 2024 年 39 卷 011 期
页码: 1218-1227
收录情况: CSCD
摘要: 【目的】检测福清山羊和努比亚山羊群体细胞介素15受体亚基α(IL15RA–interleukin 15 receptor subunit alpha, IL15RA)基因的表达谱以及突变位点多态性,分析不同位点与山羊生长性状的相关性,进一步分析IL15RA基因对山羊生长性状的影响。【方法】随机挑选福清山羊和努比亚山羊12月龄羯羊各3只,分别采集心、肝、脾、肺、肾、头颈半棘肌、背最长肌、股四头肌和臀股二头肌共9种组织,采用qRT-PCR方法构建该基因在两个品种不同组织中的表达谱,Sanger测序检测福清山羊(n=108)和努比亚山羊(n=286)群体中IL15RA基因的SNP位点,并分析其与生长性状的相关性。【结果】(1)IL15RA基因在肌肉组织中的表达水平显著低于内脏组织(P<0.05),福清山羊背最长肌表达水平显著低于努比亚山羊(P<0.05),肺部组织表达量显著高于努比亚山羊(P<0.05)。(2)福清山羊和努比亚山羊IL15RA基因内含子3存在1个InDel位点,为g.22224_22 225 Del A,Del22224。内含子6存在1个SNP位点,为g.33428A> G。(3)SNP-g.33428位点显著影响(P<0.05)福清山羊的体重、胸围、胸宽、胸深、尻宽等指标。(4)在福清山羊中,单倍型组合DD/AA、ID/GG为优势单倍型组合;在努比亚山羊中,单倍型组合ID/AA、II/GG为优势单倍型组合。【结论】IL15RA基因多态性与福清山羊和努比亚山羊生长性状显著相关,IL15RA基因可作为福清山羊和努比亚山羊生长性状选育的候选基因。
分类号: S827.2
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