细粒棘球绦虫CD151蛋白的生物信息学分析及其编码基因在不同发育阶段的表达

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵鹏鹏

作者： 赵鹏鹏;县锦雯;王宁;马勋;张艳艳;孟季蒙;王正荣;薄新文

作者机构：

关键词： 细粒棘球绦虫;CD151;抗原表位;生物信息学分析

期刊名称： 中国病原生物学杂志

ISSN：

年卷期： 2021 年 009 期

页码： 1041-1046

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的分析细粒棘球绦虫四跨膜蛋白家族成员CD151（Eg-CD151）分子特性和各发育阶段表达水平,为研发包虫病疫苗奠定基础。方法从NCBI数据库下载Eg-CD151氨基酸序列,利用ProtParam、NetPhos 3.1 Server、GPS-SUMO 2.0、Euk-mPLoc 2.0、SOPMA、SWISS MODEL、SignalP 4.1 Server、TMHMM、SMART、Antibody Epitope Prediction在线生物信息学软件预测Eg-CD151蛋白的理化性质、磷酸化位点、棕榈酰化修饰位点、亚细胞定位、二级结构、三维结构、跨膜区域、结构域、B细胞抗原表位;利用DNAMAN和MEGA进行同源序列分析并建立系统发育进化树。利用实时荧光定量PCR检测不同发育阶段Eg-CD151 mRNA相对表达量。结果 Eg-CD151蛋白由170 aa组成,为一种不稳定的跨膜蛋白,无信号肽,含2个跨膜区,分别位于6-28、136-158 aa, 3个B细胞抗原表位位于非跨膜区域;存在14个磷酸化位点,包含3个酪氨酸磷酸化位点、5个苏氨酸磷酸化位点、6个丝氨酸磷酸化位点;含一个棕榈酰化位点（139-143 aa）;二级结构主要为α-螺旋,占60.00%。同源序列比对显示,Eg-CD151与其终末宿主犬、赤狐及中间宿主牛的CD151进化关系较远。实时荧光定量PCR检测原头蚴、成虫两个发育阶段Eg-CD151 mRNA相对表达量差异无统计学意义（P>0.05）。结论生物信息学分析Eg-CD151存在多个B细胞抗原表位,可作为包虫病诊断及疫苗候选抗原。

分类号： R383.33

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