基于高通量测序分析驴皮肤病病灶中细菌菌群组成

文献类型： 中文期刊

第一作者： 樊坤

作者： 樊坤;伊艳杰;刘阳;王佳奇;梁俊杰;王子朝;王雪琴;白朋勋;张慧茹

作者机构： 河南工业大学生物工程学院;天津市畜牧兽医研究所

关键词： 驴皮肤病;高通量测序;细菌菌群组成;高丰度菌群

期刊名称： 动物医学进展

ISSN： 1007-5038

年卷期： 2019 年 06 期

页码： 37-41

收录情况： 北大核心

摘要： 驴皮具有极高的药用价值,但驴皮肤病临床发病率较高,不仅影响驴生长速度,也明显降低驴皮质量。驴皮肤病主要发生在头部和背部,临床表现为脱毛、皮屑、出血等。从天津某养殖基地采集不同症状的驴皮肤病样本37个,从中挑选6份典型皮肤病样品,采用高通量测序分析其细菌菌群组成,为研究其发病机制和防治提供基础资料。结果显示,在送检的6个样品中,发现存在4门、7纲、12目、19科、37属的细菌菌群。在属水平上,有Achromobacter、Stenotrophomonas、Pseudomonas为优势菌属,分别占总菌群的20.30%、15.00%和12.30%。通过PCoA和Venn图分析可知,皮肤出血、未出血病灶菌群组成明显不同;皮肤出血样品的菌群组成相似,Agrobacterium、Paenibacillus、Clostridium丰度较高;皮肤硬化菌群组成相似,Pantoea为主要菌群;多皮屑样品菌群组成有差异,Trichococcus是共有菌群。结果表明,引起驴皮肤病的细菌菌群组成具有明显差异,可为后期发病机制和防治提供科学依据。

分类号： S858.22

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