番茄β-BAM基因家族全基因组鉴定及其盐胁迫和外源植物生长调节剂下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李贤国

作者： 李贤国;陈兆龙;王泽鹏;戴麒;余庆辉;李宁

作者机构：

关键词： 番茄;β-淀粉酶（BAM）;生物信息学;盐胁迫;外源激素

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 1008-1019

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 淀粉酶（β-amylase, BAM）广泛参与植物体内各种生物学过程的调控，并响应激素与非生物胁迫等多种外界刺激。本研究通过生物信息分析，在番茄（Solanum lycopersicum）中鉴定出8个SlBAM成员，并进行了理化性质、基因结构、系统进化、共线性等分析；使用qPCR对SlBAM基因在盐胁迫和果实发育下的表达模式进行分析。结果表明，SlBAM均具有典型的Glyco＿hydro＿14结构域，多数SlBAM呈酸性，且都为亲水蛋白。系统发育分析显示，SlBAM可分为6个类群，相同类群具有相似的基因结构及基序分布。顺式作用元件组成表明，大部分SlBAM的表达可能与植物激素、非生物胁迫和光反应等相关。共线性分析结果显示，番茄与拟南芥BAM基因家族有一定的同源性，与马铃薯（Solanum tuberosum）亲缘关系更近。qRT-PCR分析发现，SlBAM基因主要在叶中表达，在根和茎中表达量较低。在盐胁迫下，SlBAM2、SlBAM4和SlBAM6表达上调（P＜0.05）,SlBAM1和SlBAM3表达下调（P＜0.05）。当外源激素2, 4-油菜素内酯（2, 4-epibrassinolide, EBS）浓度为0.1 mol/L时，绿熟期番茄的所有SlBAM基因都显著上调（P＜0.05）。在α-萘乙酸（1-naphthaleneacetic acid, NAA）影响下，除SlBAM6外的所有SlBAM基因都表达上调，只有SlBAM6表达下调。本研究为进一步揭示番茄BAM基因家族在响应非生物胁迫及其在果实发育中的功能提供了参考依据。

分类号： S641.2

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