甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因鉴别和表达模式

文献类型： 中文期刊

第一作者： 柳琼

作者： 柳琼;黄毅;陶章生;黄顺谋;王新发;黄邦全;刘贵华

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;TFⅢA型锌指蛋白基因;基因结构;保守基序;表达模式

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN：

年卷期： 2014 年 05 期

页码： 562-571

收录情况： CSCD

摘要： 植物TFⅢA型锌指蛋白的锌指区含有保守的QALGGH区,属于C2H2型转录因子,参与调控植物生长发育和逆境胁迫应答。参照拟南芥AtZFP基因的C2H2结构域氨基酸序列,采用生物信息学方法鉴定了46个甘蓝型油菜TFⅢA型锌指蛋白基因,分析了基因结构、生化特性、进化关系和基因表达模式。结果表明:42个基因为单锌指蛋白基因,4个为多锌指蛋白基因;40个基因不含内含子,6个基因含内含子;46个基因的氨基酸序列同源性变幅为9.0%~99.2%,氨基酸序列保守性差异明显,亚类成员间包含相同的保守基序,亚类间的保守基序不同;PlantCARE分析发现其启动子区富含激素、非生物胁迫及特定生理过程响应的顺式作用...

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