基于转录组测序筛选蒙古冰草抗旱相关基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 樊璐

作者： 樊璐;唐俊;马琳;张志鹏;蒋庆雪;李俄仁措;马巧玲;王学敏;赵威

作者机构：

关键词： 蒙古冰草;干旱;三代全长转录组;二代转录组测序;转录因子

期刊名称： 草地学报

ISSN： 1007-0435

年卷期： 2024 年 32 卷 011 期

页码： 3344-3357

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为挖掘蒙古冰草(Agropyron mongolicum Keng)抗旱相关基因并探究蒙古冰草响应干旱胁迫分子机制，本研究以蒙古冰草为材料进行转录组测序。首先将不同生长期及干旱胁迫处理后的盆栽蒙古冰草组织按照根、茎、叶、花(穗)4类分别进行混样并利用三代全长转录组测序技术建立蒙古冰草转录本参考序列数据库，共获得26 027条转录本，包含25 578个基因，利用BlastX在KEGG,KOG,Nr, Swissprot等数据库中进行比对注释，共有25 453个转录本得到注释。其次利用二代转录组测序技术对干旱胁迫处理前后水培蒙古冰草幼苗进行测序，发现干旱胁迫处理2 h, 6 h后与处理前相比分别有2669个，3668个差异表达基因。此外，根据转录组及荧光定量PCR验证结果，发现基因ERF053,ERF055,NAC100,bZIP23,ERF5和NAM-B1在干旱处理后表达量较高且均上调可能是抗旱调控关键基因，为后续蒙古冰草抗旱相关候选基因克隆及功能验证奠定了基础。

分类号： S543.9

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